Structure and dynamics of the penguin synnomes : understanding seabird life history and response to climate change through population genomics
The Southern Ocean plays a central role in the regulation of the Earth’s climate and ecosystems, and accounts for more than 20% of the world’s marine productivity. The complexity of its trohpic networks and its sheer inaccessibility make the use of bioindicator species more necessary there than anyw...
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HAL CCSD
2016
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fthalin2p3:oai:HAL:tel-01423915v1 2024-05-12T08:11:28+00:00 Structure and dynamics of the penguin synnomes : understanding seabird life history and response to climate change through population genomics Structure et dynamique des synnomes des manchots, ou comment la génomique des populations éclaire l'histoire de vie des oiseaux marins et leur réponse aux changements climatiques Cristofari, Robin Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC) Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université de Strasbourg Yvon Le Maho André Ancel 2016-02-23 https://theses.hal.science/tel-01423915 https://theses.hal.science/tel-01423915/document https://theses.hal.science/tel-01423915/file/CRISTOFARI_Robin_2016_ED414.pdf en eng HAL CCSD NNT: 2016STRAJ005 tel-01423915 https://theses.hal.science/tel-01423915 https://theses.hal.science/tel-01423915/document https://theses.hal.science/tel-01423915/file/CRISTOFARI_Robin_2016_ED414.pdf info:eu-repo/semantics/OpenAccess https://theses.hal.science/tel-01423915 Populations and Evolution [q-bio.PE]. Université de Strasbourg, 2016. English. ⟨NNT : 2016STRAJ005⟩ Population genetics RAD-sequencing Southern Ocean Spheniscids Climate change Génétique des populations Océan austral Sphéniscidés Changement climatique [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE] info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Theses 2016 fthalin2p3 2024-04-17T15:53:14Z The Southern Ocean plays a central role in the regulation of the Earth’s climate and ecosystems, and accounts for more than 20% of the world’s marine productivity. The complexity of its trohpic networks and its sheer inaccessibility make the use of bioindicator species more necessary there than anywhere else. Several penguin species (such as the King and the Emperor penguin) are therefore the focus of long-term monitoring programs.In this study, we use the information from population genomics (« RAD-sequencing » data covering the genome of hundreds of individuals from the two species’ full distribution) and from IPCC-CMIP5 numerical climate models to calibrate in the long time the more precise demographic analyses realised in the framework of field surveys, and understand penguin responses to cliamte change. Beyond its implications for the study of penguins as sentinels of the Southern Ocean, our work demonstrates the interest of a stronger integration of population genomics in demographic and behavioural investigation. L’Océan austral est l’un des pivot des écosystèmes et du climat de notre planète, qui concentre plus de 20% de la productivité primaire marine mondiale. La complexité de ses réseaux trophiques et son inaccessibilité rendent plus encore qu’ailleurs nécessaire l’utilisation d’espèces bio-indicatrices. Plusieurs espèces de manchots (comme le Manchot Royal et le Manchot Empereur) sont ainsi l’objet de programmes de suivi à long terme. Dans cette étude, nous utilisons les données offertes par la génomique des populations (« RAD-sequencing » couvrant le génome de centaines d'individus issus couvrant la distribution de ces deux espèces) et les représentations numériques du climat de l’IPCC-CMIP5 pour calibrer dans le temps long les analyses démographique plus précises réalisées à l'échelle de quelques générations dans le cadre de suivis démographiques, et mieux comprendre la réponse des manchots au changement climatique. Au-delà de ses conséquences immédiates pour l’étude des Manchots en tant que ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Southern Ocean HAL-IN2P3 (Institut national de physique nucléaire et de physique des particules) Austral Empereur ENVELOPE(141.392,141.392,-66.800,-66.800) Manchot ENVELOPE(141.400,141.400,-66.817,-66.817) Manchots ENVELOPE(141.397,141.397,-66.811,-66.811) Pivot ENVELOPE(-30.239,-30.239,-80.667,-80.667) Southern Ocean |
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The Southern Ocean plays a central role in the regulation of the Earth’s climate and ecosystems, and accounts for more than 20% of the world’s marine productivity. The complexity of its trohpic networks and its sheer inaccessibility make the use of bioindicator species more necessary there than anywhere else. Several penguin species (such as the King and the Emperor penguin) are therefore the focus of long-term monitoring programs.In this study, we use the information from population genomics (« RAD-sequencing » data covering the genome of hundreds of individuals from the two species’ full distribution) and from IPCC-CMIP5 numerical climate models to calibrate in the long time the more precise demographic analyses realised in the framework of field surveys, and understand penguin responses to cliamte change. Beyond its implications for the study of penguins as sentinels of the Southern Ocean, our work demonstrates the interest of a stronger integration of population genomics in demographic and behavioural investigation. L’Océan austral est l’un des pivot des écosystèmes et du climat de notre planète, qui concentre plus de 20% de la productivité primaire marine mondiale. La complexité de ses réseaux trophiques et son inaccessibilité rendent plus encore qu’ailleurs nécessaire l’utilisation d’espèces bio-indicatrices. Plusieurs espèces de manchots (comme le Manchot Royal et le Manchot Empereur) sont ainsi l’objet de programmes de suivi à long terme. Dans cette étude, nous utilisons les données offertes par la génomique des populations (« RAD-sequencing » couvrant le génome de centaines d'individus issus couvrant la distribution de ces deux espèces) et les représentations numériques du climat de l’IPCC-CMIP5 pour calibrer dans le temps long les analyses démographique plus précises réalisées à l'échelle de quelques générations dans le cadre de suivis démographiques, et mieux comprendre la réponse des manchots au changement climatique. Au-delà de ses conséquences immédiates pour l’étude des Manchots en tant que ... |
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Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC) Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université de Strasbourg Yvon Le Maho André Ancel |
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