Predicción computacional de la estructura terciaria de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana
Introducción. El síndrome de Hunter o mucopolisacaridosis tipo II (MC KUSIK 309900) es causado por la deficiencia de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana (E.C. 3.1.6.13). La enzima no ha sido cristalizada y por tanto sus estructuras no se conocen por deducción experimental. Objetivo. Proponer un...
Published in: | Biomédica |
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Instituto Nacional de Salud
2007
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ftdoajarticles:oai:doaj.org/article:846325596eea4f47bba47e2c842b994e 2023-05-15T15:10:04+02:00 Predicción computacional de la estructura terciaria de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana Homero Sáenz Leonardo Lareo Raúl A. Poutou Ángela C. Sosa Luis A. Barrera 2007-03-01T00:00:00Z https://doi.org/10.7705/biomedica.v27i1.229 https://doaj.org/article/846325596eea4f47bba47e2c842b994e EN ES eng spa Instituto Nacional de Salud http://www.revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/229 https://doaj.org/toc/0120-4157 0120-4157 doi:10.7705/biomedica.v27i1.229 https://doaj.org/article/846325596eea4f47bba47e2c842b994e Biomédica: revista del Instituto Nacional de Salud, Vol 27, Iss 1, Pp 7-20 (2007) mucopolysaccharidosis II iduronate sulfatase tertiary protein structure computing methods Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 article 2007 ftdoajarticles https://doi.org/10.7705/biomedica.v27i1.229 2022-12-30T23:12:55Z Introducción. El síndrome de Hunter o mucopolisacaridosis tipo II (MC KUSIK 309900) es causado por la deficiencia de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana (E.C. 3.1.6.13). La enzima no ha sido cristalizada y por tanto sus estructuras no se conocen por deducción experimental. Objetivo. Proponer un modelo computacional para la estructura tridimensional de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana. Materiales y métodos. Se realizó un análisis computacional de esta enzima empleando programas de libre acceso en internet como Comput pI/MW, JaMBW Chapter 3.1.7, SWISSMODEL, 3D-PSSM, ProSup. Los procesos de minimización de energía se realizaron con el programa Discover 3 del paquete Insight II (2004). Resultados. Se propone un modelo tridimensional de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana que presenta 33,3% en hélice, 7,2% en hoja plegada y 59,5% en enrollamiento al azar (coil). Se hallaron valores de RMS (del inglés Root Mean Square) de 0,78 y 0,86Å al compararla con otras enzimas de la misma familia. El modelo revela cinco sitios potenciales de N-glicosilación y una entrada al bolsillo que contiene los aminoácidos que componen el sitio activo. Usando este modelo se encontró una buena correlación entre el tipo de mutaciones y la gravedad de la enfermedad en 20 pacientes analizados. Conclusión. Los valores de RMS y la correlación genotipo-fenotipo en los pacientes analizados sugieren el modelo puede usarse para predecir ciertos aspectos del comportamiento biológico de la enzima. Article in Journal/Newspaper Arctic Directory of Open Access Journals: DOAJ Articles Arctic Azar ENVELOPE(-63.733,-63.733,-64.983,-64.983) Entrada ENVELOPE(-60.552,-60.552,-62.998,-62.998) Inglés ENVELOPE(-59.650,-59.650,-62.417,-62.417) Biomédica 27 1 7 |
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Introducción. El síndrome de Hunter o mucopolisacaridosis tipo II (MC KUSIK 309900) es causado por la deficiencia de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana (E.C. 3.1.6.13). La enzima no ha sido cristalizada y por tanto sus estructuras no se conocen por deducción experimental. Objetivo. Proponer un modelo computacional para la estructura tridimensional de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana. Materiales y métodos. Se realizó un análisis computacional de esta enzima empleando programas de libre acceso en internet como Comput pI/MW, JaMBW Chapter 3.1.7, SWISSMODEL, 3D-PSSM, ProSup. Los procesos de minimización de energía se realizaron con el programa Discover 3 del paquete Insight II (2004). Resultados. Se propone un modelo tridimensional de la iduronato 2-sulfato sulfatasa humana que presenta 33,3% en hélice, 7,2% en hoja plegada y 59,5% en enrollamiento al azar (coil). Se hallaron valores de RMS (del inglés Root Mean Square) de 0,78 y 0,86Å al compararla con otras enzimas de la misma familia. El modelo revela cinco sitios potenciales de N-glicosilación y una entrada al bolsillo que contiene los aminoácidos que componen el sitio activo. Usando este modelo se encontró una buena correlación entre el tipo de mutaciones y la gravedad de la enfermedad en 20 pacientes analizados. Conclusión. Los valores de RMS y la correlación genotipo-fenotipo en los pacientes analizados sugieren el modelo puede usarse para predecir ciertos aspectos del comportamiento biológico de la enzima. |
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