La región intergénica del gen H2A apoya las subpoblaciones KP1(-) y KP1(+) de Trypanosoma rangeli
Introducción. Con base en la amplificación del ADN de los minicírculos del cinetoplasto y de los genes miniexón, Trypanosoma rangeli ha sido clasificado en las subpoblaciones KP1(-) y KP1(+). Objetivo. Comparar la región intergénica de los genes H2A entre cepas KP1(+) y KP1(-) de T. rangeli, con el...
Published in: | Biomédica |
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Instituto Nacional de Salud
2007
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ftdoajarticles:oai:doaj.org/article:67b97ecf325d4b858a03f6e272b26eee 2023-05-15T15:12:15+02:00 La región intergénica del gen H2A apoya las subpoblaciones KP1(-) y KP1(+) de Trypanosoma rangeli Brian Alejandro Suárez Claudia Liliana Cuervo Concepción Judith Puerta 2007-09-01T00:00:00Z https://doi.org/10.7705/biomedica.v27i3.203 https://doaj.org/article/67b97ecf325d4b858a03f6e272b26eee EN ES eng spa Instituto Nacional de Salud http://www.revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/203 https://doaj.org/toc/0120-4157 0120-4157 doi:10.7705/biomedica.v27i3.203 https://doaj.org/article/67b97ecf325d4b858a03f6e272b26eee Biomédica: revista del Instituto Nacional de Salud, Vol 27, Iss 3, Pp 410-8 (2007) Trypanosoma/genetics DNA intergenic genes histones/genetics conserved sequence phylogeny Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 article 2007 ftdoajarticles https://doi.org/10.7705/biomedica.v27i3.203 2022-12-30T23:59:01Z Introducción. Con base en la amplificación del ADN de los minicírculos del cinetoplasto y de los genes miniexón, Trypanosoma rangeli ha sido clasificado en las subpoblaciones KP1(-) y KP1(+). Objetivo. Comparar la región intergénica de los genes H2A entre cepas KP1(+) y KP1(-) de T. rangeli, con el fin de aportar evidencias a dicha división. Materiales y métodos. Se amplificó, clonó y determinó la secuencia de la región intergénica de los genes h2a de las cepas KP1(-) Tre y 5048 y de la cepa Choachí [KP1(+)]. Dichas secuencias, junto con las reportadas para las cepas C23 [KP1(-)] y H14 [KP1(+)], fueron utilizadas para la reconstrucción de árboles filogenéticos basados en los métodos de neighbor-joining, máxima parsimonia y máxima verosimilitud, utilizando la cepa Y de Trypanosoma cruzi como grupo raíz externo. Resultados. Se evidenció heterogeneidad intraespecífica en el tamaño de la región estudiada, soportados por valores bootstrap de 85% (neighbor-joining), 66% (máxima parsimonia) y 57% (máxima verosimilitud), los resultados indican que las cepas KP1(-) se agrupan aparte, claramente diferenciadas de las cepas KP1(+), las cuales presentan una mayor heterogeneidad intraespecífica en tamaño y secuencia. Además, se encontró mayor proximidad filogenética entre T. rangeli y T. cruzi que entre T. rangeli y Trypanosoma brucei. Conclusiones. Los análisis filogenéticos basados en la región intergénica de los genes h2a de las cepas estudiadas apoyan la división de T. rangeli en las subpoblaciones KP1(-) y KP1(+). Sin embargo, se requiere estudiar un mayor número de cepas para confirmar estos hallazgos. Article in Journal/Newspaper Arctic Directory of Open Access Journals: DOAJ Articles Arctic Biomédica 27 3 410 |
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