DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose

Šiame darbe mikrosatelitinių DNR sekų metodu buvo ištirta 24 taurieji elniai iš 4 rajonų, 8 skirtingų Lietuvos miškų. Pagrindinis tyrimo objektas buvo nustatyti tauriųjų elnių DNR mikrosatelitų kintamumą Lietuvoje. Elnių audinių bei kepenų pavyzdžiai surinkti 2003 - 2005 metų medžioklės sezonuose iš...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Jakubanis, Irena
Other Authors: Paulauskas, Algimantas, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University
Format: Master Thesis
Language:Lithuanian
Published: Lithuanian Academic Libraries Network (LABT) 2008
Subjects:
Online Access:http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571
id ftdisslitauen:oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571
record_format openpolar
spelling ftdisslitauen:oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571 2023-05-15T18:04:27+02:00 DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose The application of microsatellite polymorphism for the genetical variability research of Lithuanian red deer (Cervus elaphus) Jakubanis, Irena Paulauskas, Algimantas Ambrasienė, Daiva Vytautas Magnus University 2008-06-28 application/pdf http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571 lit lit Lithuanian Academic Libraries Network (LABT) Vytautas Magnus University Unrestricted LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571 VDU-shzankxsvhq-20080528-095240 http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571/DS.005.0.01.ETD Biology Taurusis elnias DNR mikrosatelitai Populiacija Genetinė įvairovė Red deer Microsatellites Populiation Genetical variability Master thesis 2008 ftdisslitauen 2015-09-24T09:42:47Z Šiame darbe mikrosatelitinių DNR sekų metodu buvo ištirta 24 taurieji elniai iš 4 rajonų, 8 skirtingų Lietuvos miškų. Pagrindinis tyrimo objektas buvo nustatyti tauriųjų elnių DNR mikrosatelitų kintamumą Lietuvoje. Elnių audinių bei kepenų pavyzdžiai surinkti 2003 - 2005 metų medžioklės sezonuose iš medžiotojų nušautų individų. Ištyrus 7 mikrosatelitinius lokusus (RT1, RT23, NVHRT16, NVHRT21, NVHRT48, NVHRT73, BM888) nustatyta, kad lokusai BM888, NVHRT48 bei NVHRT21 nepilnai tinka Lietuvos taurųjų elnių populiacinei analizei, kadangi po amplifikacijos ne pas visus tirtus individus buvo matoma pradmenų amplifikacija. Panevėžio rajone aptiktas vienas retas alelis (0,042 dažnumas) RT1 lokuso alelyje esančiam 224 bp srityje Pastebėta, kad Lietuvoje gyvenančių taurųjų elnių teorinis ir faktinis heterozigotiškumas artimas į kitų šalių taurųjų elnių populiacijų heterozigotiškumus. Jurbarko rajono populiacija pasižymi didžiausiu faktiniu heterozigotiškumu, kuris siek�� 0,75. Didžiausias efektyvus alelių skaičius (ne=3,45) pastebėtas Panevėžio rajono elnių populiacijoje. Tiek pagal DNR tiek pagal izofermentine analizę labiausia genetiškai artimos populiacijos yra Minčios ir Ažvinčių, labiausiai nutolusios pagal mūsų tirtus polimorfinius lokusus yra Mantvilių ir Sipailiškių miškų tauriųjų elnių populiacijos. Lietuvos taurųjų elnių populiacija yra vienoje šakoje su Vengrijos bei Škotijos taurųjų elnių populiacijomis, tačiau nutolusi nuo Švedijos taurųjų elnių populiacijos. We investigated tissue and liver of 24 red deers (Cervus elaphus). Samples for analysis were collected from 4 localities, 8 different forests of Lithuania during 2004-2005 hunting seasons. We used 7 microsatellite primers (RT1, RT23, BM888, NVHRT16, NVHRT21, NVHRT48, NVHRT73) derived from reindeer (Rangifer tarandus) to find out which of them is the best suitable for genetical investigations of red deer. BM888, NVHRT48 and NVHRT21 did not appeared suitable for whole population analysis because not in all samples was detected amplification. The analysis of alleles showed the rarest alleles is RT1 locus 224 bp alleles (0,042). Lithuanian red deers observed and expected heterozygosities are within the range of values previously found for reed deers. It was estimated that the biggest observed heterozygosity were Jurbarko localities forest (Ho= 0,75). The biggest effective number of alleles (ne=3,45) was observed in Panevėžio locality red deer population. According to our DNA and antedate done isoenzyme investigation the most genetically similar were Minčios and Ažvinčių red deer subpopulations; the most different were Sipailiškių and Mantvilių ones. Lithuanian red deer are in one cluster with Hungarian and Scottish red deers populations, they are in separate cluster with Swedish red deer population. Master Thesis Rangifer tarandus Lietuvos virtuali biblioteka bei visateksčių dokumentų duomenų bazės sukūrimas Kad’ ENVELOPE(40.287,40.287,64.964,64.964)
institution Open Polar
collection Lietuvos virtuali biblioteka bei visateksčių dokumentų duomenų bazės sukūrimas
op_collection_id ftdisslitauen
language Lithuanian
topic Biology
Taurusis elnias
DNR mikrosatelitai
Populiacija
Genetinė įvairovė
Red deer
Microsatellites
Populiation
Genetical variability
spellingShingle Biology
Taurusis elnias
DNR mikrosatelitai
Populiacija
Genetinė įvairovė
Red deer
Microsatellites
Populiation
Genetical variability
Jakubanis, Irena
DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
topic_facet Biology
Taurusis elnias
DNR mikrosatelitai
Populiacija
Genetinė įvairovė
Red deer
Microsatellites
Populiation
Genetical variability
description Šiame darbe mikrosatelitinių DNR sekų metodu buvo ištirta 24 taurieji elniai iš 4 rajonų, 8 skirtingų Lietuvos miškų. Pagrindinis tyrimo objektas buvo nustatyti tauriųjų elnių DNR mikrosatelitų kintamumą Lietuvoje. Elnių audinių bei kepenų pavyzdžiai surinkti 2003 - 2005 metų medžioklės sezonuose iš medžiotojų nušautų individų. Ištyrus 7 mikrosatelitinius lokusus (RT1, RT23, NVHRT16, NVHRT21, NVHRT48, NVHRT73, BM888) nustatyta, kad lokusai BM888, NVHRT48 bei NVHRT21 nepilnai tinka Lietuvos taurųjų elnių populiacinei analizei, kadangi po amplifikacijos ne pas visus tirtus individus buvo matoma pradmenų amplifikacija. Panevėžio rajone aptiktas vienas retas alelis (0,042 dažnumas) RT1 lokuso alelyje esančiam 224 bp srityje Pastebėta, kad Lietuvoje gyvenančių taurųjų elnių teorinis ir faktinis heterozigotiškumas artimas į kitų šalių taurųjų elnių populiacijų heterozigotiškumus. Jurbarko rajono populiacija pasižymi didžiausiu faktiniu heterozigotiškumu, kuris siek�� 0,75. Didžiausias efektyvus alelių skaičius (ne=3,45) pastebėtas Panevėžio rajono elnių populiacijoje. Tiek pagal DNR tiek pagal izofermentine analizę labiausia genetiškai artimos populiacijos yra Minčios ir Ažvinčių, labiausiai nutolusios pagal mūsų tirtus polimorfinius lokusus yra Mantvilių ir Sipailiškių miškų tauriųjų elnių populiacijos. Lietuvos taurųjų elnių populiacija yra vienoje šakoje su Vengrijos bei Škotijos taurųjų elnių populiacijomis, tačiau nutolusi nuo Švedijos taurųjų elnių populiacijos. We investigated tissue and liver of 24 red deers (Cervus elaphus). Samples for analysis were collected from 4 localities, 8 different forests of Lithuania during 2004-2005 hunting seasons. We used 7 microsatellite primers (RT1, RT23, BM888, NVHRT16, NVHRT21, NVHRT48, NVHRT73) derived from reindeer (Rangifer tarandus) to find out which of them is the best suitable for genetical investigations of red deer. BM888, NVHRT48 and NVHRT21 did not appeared suitable for whole population analysis because not in all samples was detected amplification. The analysis of alleles showed the rarest alleles is RT1 locus 224 bp alleles (0,042). Lithuanian red deers observed and expected heterozygosities are within the range of values previously found for reed deers. It was estimated that the biggest observed heterozygosity were Jurbarko localities forest (Ho= 0,75). The biggest effective number of alleles (ne=3,45) was observed in Panevėžio locality red deer population. According to our DNA and antedate done isoenzyme investigation the most genetically similar were Minčios and Ažvinčių red deer subpopulations; the most different were Sipailiškių and Mantvilių ones. Lithuanian red deer are in one cluster with Hungarian and Scottish red deers populations, they are in separate cluster with Swedish red deer population.
author2 Paulauskas, Algimantas
Ambrasienė, Daiva
Vytautas Magnus University
format Master Thesis
author Jakubanis, Irena
author_facet Jakubanis, Irena
author_sort Jakubanis, Irena
title DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
title_short DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
title_full DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
title_fullStr DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
title_full_unstemmed DNR mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas Lietuvos tauriųjų elnių(Cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
title_sort dnr mikrosatelitinio polimorfizno panaudojimas lietuvos tauriųjų elnių(cervus elaphus)genetinės įvairovės tyrimuose
publisher Lithuanian Academic Libraries Network (LABT)
publishDate 2008
url http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571
long_lat ENVELOPE(40.287,40.287,64.964,64.964)
geographic Kad’
geographic_facet Kad’
genre Rangifer tarandus
genre_facet Rangifer tarandus
op_source LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571
VDU-shzankxsvhq-20080528-095240
http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080628_085526-99571/DS.005.0.01.ETD
op_rights Unrestricted
_version_ 1766175832631410688