Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose

Donatas Naugžemys Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose SANTRAUKA RAPD metodu buvo tirta pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) genetinė įvairovė. Ištirtos penkios populiacijos iš skirtingų Lietuvos rajonų. Šiuo metodu gauti 93 lokusai, iš kurių 7...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Naugžemys, Donatas
Other Authors: Žvingila, Donatas, Vilnius University
Format: Master Thesis
Language:Lithuanian
Published: Lithuanian Academic Libraries Network (LABT) 2009
Subjects:
Online Access:http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110
id ftdisslitauen:oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110
record_format openpolar
spelling ftdisslitauen:oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110 2023-05-15T15:14:09+02:00 Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose Analysis of genetic diversity in yellow marsh saxifrage (saxifraga hirculus l.) populations Naugžemys, Donatas Žvingila, Donatas Vilnius University 2009-09-08 application/pdf http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110 lit lit Lithuanian Academic Libraries Network (LABT) Vilnius University Unrestricted LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110 VU-nlfbndeorio-20090908-193919 http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110/DS.005.0.01.ETD Pelkinė uolaskėlė Genetinė įvairovė Populiacijų diferenciacija RAPD Master thesis 2009 ftdisslitauen 2015-09-24T09:41:49Z Donatas Naugžemys Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose SANTRAUKA RAPD metodu buvo tirta pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) genetinė įvairovė. Ištirtos penkios populiacijos iš skirtingų Lietuvos rajonų. Šiuo metodu gauti 93 lokusai, iš kurių 71% buvo polimorfiški. Nustatytas ryšys tarp Nei genų įvairovės ir tirtų populiacijų dydžio. Didžiausias DNR polimorfizmas nustatytas Merkinės (86,36%), o mažiausias – Juodlės populiacijoje (71,21%). UPGMA ir PCO metodai išryškino tirtų populiacijų genetinį savitumą. AMOVA parodė gana aukštą diferenciacijos lygį tarp tirtų S. hirculus populiacijų, kuris buvo lygus 27%. Genetinis atstumas tarp populiacijų svyravo nuo 0,168 iki 0,258. Merkinės ir Juodlės populiacojose buvo identifikuota keletas populiacijoms specifinių lokusų. Koreliacijos tarp tirtų populiacijų genetinių ir geografinių atstumų neaptikta. Kadangi visi tirti 76 augalai buvo genetiškai skirtingi, galima manyti, kad S. hirculus populiacijos atsinaujina iš sėklų sudygusiais augalais. Donatas Naugžemys Analysis of genetic diversity in yellow marsh Saxifrage (SAXIFRAGA HIRCULUS L.) populations SUMMARY We used RAPDs (random amplified polymorphic DNAs) to analyse genetic diversity in the arctic – alpine yellow marsh Saxifrage (Saxifraga hirculus L.) that is considered as glacial relict. Five populations from different regions of Lithuania were studied. A total of 76 individuals were included in this research. In the RAPD analysis 93 loci we detected, of which 71 were polymorphic. All studied plants showed different RAPD phenotypes. The percentage of polymorphic bands and Nei’s gene diversity within populations correlated with population size. UPGMA and PCO analyses showed genetic specificity of studied populations. AMOVA revealed rather high level of differentiation among studied populations of S. hirculus. The interpopulation variance component accounted for 27%. The genetic distance between populations ranged from 0.168 to 0.258. Some population specific minor loci were identified in Merkinė and Juodlė populations. There was no correlation found between genetic and geographic distance of studied populations. Our results suggest that sexual reproduction plays a significant role in the establishment of genetic structure of S. hirculus populations. Master Thesis Arctic Marsh Saxifrage Saxifraga hirculus Lietuvos virtuali biblioteka bei visateksčių dokumentų duomenų bazės sukūrimas Arctic Kad’ ENVELOPE(40.287,40.287,64.964,64.964) Gana ENVELOPE(-63.750,-63.750,-66.150,-66.150) Yellow Marsh ENVELOPE(-57.693,-57.693,49.897,49.897)
institution Open Polar
collection Lietuvos virtuali biblioteka bei visateksčių dokumentų duomenų bazės sukūrimas
op_collection_id ftdisslitauen
language Lithuanian
topic Pelkinė uolaskėlė
Genetinė įvairovė
Populiacijų diferenciacija
RAPD
spellingShingle Pelkinė uolaskėlė
Genetinė įvairovė
Populiacijų diferenciacija
RAPD
Naugžemys, Donatas
Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
topic_facet Pelkinė uolaskėlė
Genetinė įvairovė
Populiacijų diferenciacija
RAPD
description Donatas Naugžemys Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose SANTRAUKA RAPD metodu buvo tirta pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) genetinė įvairovė. Ištirtos penkios populiacijos iš skirtingų Lietuvos rajonų. Šiuo metodu gauti 93 lokusai, iš kurių 71% buvo polimorfiški. Nustatytas ryšys tarp Nei genų įvairovės ir tirtų populiacijų dydžio. Didžiausias DNR polimorfizmas nustatytas Merkinės (86,36%), o mažiausias – Juodlės populiacijoje (71,21%). UPGMA ir PCO metodai išryškino tirtų populiacijų genetinį savitumą. AMOVA parodė gana aukštą diferenciacijos lygį tarp tirtų S. hirculus populiacijų, kuris buvo lygus 27%. Genetinis atstumas tarp populiacijų svyravo nuo 0,168 iki 0,258. Merkinės ir Juodlės populiacojose buvo identifikuota keletas populiacijoms specifinių lokusų. Koreliacijos tarp tirtų populiacijų genetinių ir geografinių atstumų neaptikta. Kadangi visi tirti 76 augalai buvo genetiškai skirtingi, galima manyti, kad S. hirculus populiacijos atsinaujina iš sėklų sudygusiais augalais. Donatas Naugžemys Analysis of genetic diversity in yellow marsh Saxifrage (SAXIFRAGA HIRCULUS L.) populations SUMMARY We used RAPDs (random amplified polymorphic DNAs) to analyse genetic diversity in the arctic – alpine yellow marsh Saxifrage (Saxifraga hirculus L.) that is considered as glacial relict. Five populations from different regions of Lithuania were studied. A total of 76 individuals were included in this research. In the RAPD analysis 93 loci we detected, of which 71 were polymorphic. All studied plants showed different RAPD phenotypes. The percentage of polymorphic bands and Nei’s gene diversity within populations correlated with population size. UPGMA and PCO analyses showed genetic specificity of studied populations. AMOVA revealed rather high level of differentiation among studied populations of S. hirculus. The interpopulation variance component accounted for 27%. The genetic distance between populations ranged from 0.168 to 0.258. Some population specific minor loci were identified in Merkinė and Juodlė populations. There was no correlation found between genetic and geographic distance of studied populations. Our results suggest that sexual reproduction plays a significant role in the establishment of genetic structure of S. hirculus populations.
author2 Žvingila, Donatas
Vilnius University
format Master Thesis
author Naugžemys, Donatas
author_facet Naugžemys, Donatas
author_sort Naugžemys, Donatas
title Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
title_short Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
title_full Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
title_fullStr Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
title_full_unstemmed Genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (Saxifraga hirculus L.) populiacijose
title_sort genetinės įvairovės tyrimas pelkinės uolaskėlės (saxifraga hirculus l.) populiacijose
publisher Lithuanian Academic Libraries Network (LABT)
publishDate 2009
url http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110
long_lat ENVELOPE(40.287,40.287,64.964,64.964)
ENVELOPE(-63.750,-63.750,-66.150,-66.150)
ENVELOPE(-57.693,-57.693,49.897,49.897)
geographic Arctic
Kad’
Gana
Yellow Marsh
geographic_facet Arctic
Kad’
Gana
Yellow Marsh
genre Arctic
Marsh Saxifrage
Saxifraga hirculus
genre_facet Arctic
Marsh Saxifrage
Saxifraga hirculus
op_source LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110
VU-nlfbndeorio-20090908-193919
http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20090908_193919-65110/DS.005.0.01.ETD
op_rights Unrestricted
_version_ 1766344642348974080