Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...

Abstract Global warming is predicted to exert negative impacts on plant growth due to the damaging effect of high temperatures on plant physiology. Revealing the genetic architecture underlying the heat stress response is therefore crucial for the development of conservation strategies, and for bree...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Maximiliano Estravis‐Barcalá, Katrin Heer, Paula Marchelli, Birgit Ziegenhagen, María Verónica Arana, Nicolás Bellora
Format: Text
Language:English
Published: OpenAlex 2021
Subjects:
Online Access:https://dx.doi.org/10.60692/vr13t-nzg42
https://gresis.osc.int//doi/10.60692/vr13t-nzg42
id ftdatacite:10.60692/vr13t-nzg42
record_format openpolar
spelling ftdatacite:10.60692/vr13t-nzg42 2024-09-15T17:41:49+00:00 Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ... Maximiliano Estravis‐Barcalá Katrin Heer Paula Marchelli Birgit Ziegenhagen María Verónica Arana Nicolás Bellora 2021 https://dx.doi.org/10.60692/vr13t-nzg42 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/vr13t-nzg42 en eng OpenAlex https://dx.doi.org/10.60692/1aeym-5ty55 cc-by Molecular Mechanisms of Plant Development and Regulation Plant Science Agricultural and Biological Sciences Life Sciences Molecular Mechanisms of Photosynthesis and Photoprotection Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Molecular Responses to Abiotic Stress in Plants Stress Signaling WRKY protein domain Biology Transcriptome Arabidopsis thaliana Gene Arabidopsis Transcription factor Heat shock protein Genetics FOS Biological sciences Gene expression Cell biology Botany Ecology Mutant Text ScholarlyArticle article-journal 2021 ftdatacite https://doi.org/10.60692/vr13t-nzg4210.60692/1aeym-5ty55 2024-08-01T11:17:02Z Abstract Global warming is predicted to exert negative impacts on plant growth due to the damaging effect of high temperatures on plant physiology. Revealing the genetic architecture underlying the heat stress response is therefore crucial for the development of conservation strategies, and for breeding heat-resistant plant genotypes. Here we investigated the transcriptional changes induced by heat in Nothofagus pumilio , an emblematic tree species of the sub-Antarctic forests of South America. Through the performance of RNA-seq of leaves of plants exposed to 20°C (control) or 34°C (heat shock), we generated the first transcriptomic resource for the species. We also studied the changes in protein-coding transcripts expression in response to heat. We found 5,214 contigs differentially expressed between temperatures. The heat treatment resulted in a down-regulation of genes related to photosynthesis and carbon metabolism, whereas secondary metabolism, protein re-folding and response to stress were ... : من المتوقع أن يكون للاحترار العالمي آثار سلبية على نمو النبات بسبب التأثير الضار لارتفاع درجات الحرارة على فسيولوجيا النبات. لذلك فإن الكشف عن البنية الوراثية الكامنة وراء استجابة الإجهاد الحراري أمر بالغ الأهمية لتطوير استراتيجيات الحفظ، ولتربية الأنماط الوراثية النباتية المقاومة للحرارة. هنا قمنا بالتحقيق في التغييرات النسخية الناجمة عن الحرارة في Nothofagus pumilio، وهو نوع من الأشجار الرمزية لغابات شبه القارة القطبية الجنوبية في أمريكا الجنوبية. من خلال أداء تسلسل الحمض النووي الريبوزي لأوراق النباتات المعرضة لـ 20 درجة مئوية (التحكم) أو 34 درجة مئوية (الصدمة الحرارية)، أنشأنا أول مورد نصي للأنواع. درسنا أيضًا التغييرات في تعبير نصوص ترميز البروتين استجابة للحرارة. وجدنا 5,214 متجاورًا معبرًا عنها بشكل تفاضلي بين درجات الحرارة. أدت المعالجة الحرارية إلى انخفاض تنظيم الجينات المتعلقة بعملية التمثيل الضوئي واستقلاب الكربون، في حين تم زيادة تنظيم الأيض الثانوي وإعادة طي البروتين والاستجابة للإجهاد. علاوة على ذلك، تم الترويج للعديد من عائلات عوامل النسخ مثل WRKY أو ERF بواسطة الحرارة، إلى جانب آلات اللصق ... Text Antarc* Antarctic DataCite
institution Open Polar
collection DataCite
op_collection_id ftdatacite
language English
topic Molecular Mechanisms of Plant Development and Regulation
Plant Science
Agricultural and Biological Sciences
Life Sciences
Molecular Mechanisms of Photosynthesis and Photoprotection
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Molecular Responses to Abiotic Stress in Plants
Stress Signaling
WRKY protein domain
Biology
Transcriptome
Arabidopsis thaliana
Gene
Arabidopsis
Transcription factor
Heat shock protein
Genetics
FOS Biological sciences
Gene expression
Cell biology
Botany
Ecology
Mutant
spellingShingle Molecular Mechanisms of Plant Development and Regulation
Plant Science
Agricultural and Biological Sciences
Life Sciences
Molecular Mechanisms of Photosynthesis and Photoprotection
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Molecular Responses to Abiotic Stress in Plants
Stress Signaling
WRKY protein domain
Biology
Transcriptome
Arabidopsis thaliana
Gene
Arabidopsis
Transcription factor
Heat shock protein
Genetics
FOS Biological sciences
Gene expression
Cell biology
Botany
Ecology
Mutant
Maximiliano Estravis‐Barcalá
Katrin Heer
Paula Marchelli
Birgit Ziegenhagen
María Verónica Arana
Nicolás Bellora
Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
topic_facet Molecular Mechanisms of Plant Development and Regulation
Plant Science
Agricultural and Biological Sciences
Life Sciences
Molecular Mechanisms of Photosynthesis and Photoprotection
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Molecular Responses to Abiotic Stress in Plants
Stress Signaling
WRKY protein domain
Biology
Transcriptome
Arabidopsis thaliana
Gene
Arabidopsis
Transcription factor
Heat shock protein
Genetics
FOS Biological sciences
Gene expression
Cell biology
Botany
Ecology
Mutant
description Abstract Global warming is predicted to exert negative impacts on plant growth due to the damaging effect of high temperatures on plant physiology. Revealing the genetic architecture underlying the heat stress response is therefore crucial for the development of conservation strategies, and for breeding heat-resistant plant genotypes. Here we investigated the transcriptional changes induced by heat in Nothofagus pumilio , an emblematic tree species of the sub-Antarctic forests of South America. Through the performance of RNA-seq of leaves of plants exposed to 20°C (control) or 34°C (heat shock), we generated the first transcriptomic resource for the species. We also studied the changes in protein-coding transcripts expression in response to heat. We found 5,214 contigs differentially expressed between temperatures. The heat treatment resulted in a down-regulation of genes related to photosynthesis and carbon metabolism, whereas secondary metabolism, protein re-folding and response to stress were ... : من المتوقع أن يكون للاحترار العالمي آثار سلبية على نمو النبات بسبب التأثير الضار لارتفاع درجات الحرارة على فسيولوجيا النبات. لذلك فإن الكشف عن البنية الوراثية الكامنة وراء استجابة الإجهاد الحراري أمر بالغ الأهمية لتطوير استراتيجيات الحفظ، ولتربية الأنماط الوراثية النباتية المقاومة للحرارة. هنا قمنا بالتحقيق في التغييرات النسخية الناجمة عن الحرارة في Nothofagus pumilio، وهو نوع من الأشجار الرمزية لغابات شبه القارة القطبية الجنوبية في أمريكا الجنوبية. من خلال أداء تسلسل الحمض النووي الريبوزي لأوراق النباتات المعرضة لـ 20 درجة مئوية (التحكم) أو 34 درجة مئوية (الصدمة الحرارية)، أنشأنا أول مورد نصي للأنواع. درسنا أيضًا التغييرات في تعبير نصوص ترميز البروتين استجابة للحرارة. وجدنا 5,214 متجاورًا معبرًا عنها بشكل تفاضلي بين درجات الحرارة. أدت المعالجة الحرارية إلى انخفاض تنظيم الجينات المتعلقة بعملية التمثيل الضوئي واستقلاب الكربون، في حين تم زيادة تنظيم الأيض الثانوي وإعادة طي البروتين والاستجابة للإجهاد. علاوة على ذلك، تم الترويج للعديد من عائلات عوامل النسخ مثل WRKY أو ERF بواسطة الحرارة، إلى جانب آلات اللصق ...
format Text
author Maximiliano Estravis‐Barcalá
Katrin Heer
Paula Marchelli
Birgit Ziegenhagen
María Verónica Arana
Nicolás Bellora
author_facet Maximiliano Estravis‐Barcalá
Katrin Heer
Paula Marchelli
Birgit Ziegenhagen
María Verónica Arana
Nicolás Bellora
author_sort Maximiliano Estravis‐Barcalá
title Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
title_short Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
title_full Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
title_fullStr Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
title_full_unstemmed Deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in Nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في Nothofagus pumilio ...
title_sort deciphering the transcriptomic regulation of heat stress responses in nothofagus pumilio ... : فك تشفير التنظيم النسخي لاستجابات الإجهاد الحراري في nothofagus pumilio ...
publisher OpenAlex
publishDate 2021
url https://dx.doi.org/10.60692/vr13t-nzg42
https://gresis.osc.int//doi/10.60692/vr13t-nzg42
genre Antarc*
Antarctic
genre_facet Antarc*
Antarctic
op_relation https://dx.doi.org/10.60692/1aeym-5ty55
op_rights cc-by
op_doi https://doi.org/10.60692/vr13t-nzg4210.60692/1aeym-5ty55
_version_ 1810488074044440576