Indentification and Determination of Toxin Genes of Vibrio Strains Caused Hemorrhagic Disease on Red Drum (Sciaenops ocellatus) by PCR Method. ... : تحديد وتحديد الجينات السامة لسلالات الضمة المسببة للأمراض النزفية على الطبل الأحمر (Sciaenops ocellatus) عن طريق PCR الطريقة. ...

• Main Authors: Nguyen Quang Linh, Yen Thi Hai Pham, Tram Nguyen
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2020
• Subjects: Dynamics and Pathogenesis of Cholera Bacteria; Endocrinology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Plant Responses to Flooding Stress; Plant Science; Agricultural and Biological Sciences; Vibrio cholerae; Vibrio alginolyticus; Biology; 16S ribosomal RNA; Vibrio; Microbiology; FOS Biological sciences; Phylogenetic tree; Nucleotide diversity; Toxin; Population; Haplotype; Bacteria; Genotype; Gene; Molecular biology; Genetics; Demography; FOS Sociology; Sociology; Red drum; Sciaenops ocellatus
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/tzyf6-3br96; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/tzyf6-3br96

Abstract In this study, we isolated thirty strains of Vibrio from three different organs (brain, hemorrhagic site and digestive system) of Sciaenops ocellatus disease. The results showed that nucleotide sequences 16S rRNA region are highly, similar to those of V. alginolyticus , V. azureus , V. fluvialis and V. orientalis is published on Genebank, ranging from 98.05 to 100 %. The digestive system has the most common Vibrio strains ( V. alginolyticus , V. azureu s and V. fluvialis ). Thereout, We found 25/30 strains of Vibrio containing from 1 to 3 toxin genes. None of V. parahaemolyticus present. Six parameters were used to measure the DNA polymorphism of thirty-three homologous DNA sequences in this Vibrio bacteria population. The results indicated that, number of separate polymorphic sites (S), total number of mutant sites (Eta), number of haplotype (h), haplotype diversity (Hd), average number of nucleotide differences (k), nucleotide diversity (Pi) were 98 (S) 103 (Eta), 9 (h), 0.887±0.032 (Hd), 25.789 ... : الملخص في هذه الدراسة، قمنا بعزل ثلاثين سلالة من الضمة من ثلاثة أعضاء مختلفة (الدماغ والموقع النزفي والجهاز الهضمي) من مرض سينوبس أوسيلاتوس. أظهرت النتائج أن متواليات النوكليوتيدات 16S منطقة الحمض النووي الريبوزي الريبوزي عالية، مماثلة لتلك الخاصة بـ V. alginolyticus ، V. azureus ، V. fluvialis و V. orientalis يتم نشرها على بنك الجينات، تتراوح من 98.05 إلى 100 ٪. يحتوي الجهاز الهضمي على سلالات الضمة الأكثر شيوعًا ( V. alginolyticus ، V. azureu s و V. fluvialis ). هناك، وجدنا 25/30 سلالات من الضمة تحتوي على 1 إلى 3 جينات سامة. لا يوجد أي من V. parahaemolyticus. تم استخدام ستة معلمات لقياس تعدد أشكال الحمض النووي لثلاثة وثلاثين تسلسلًا من الحمض النووي المتماثل في مجموعة بكتيريا الضمة هذه. أشارت النتائج إلى أن عدد المواقع المنفصلة متعددة الأشكال (S)، إجمالي عدد المواقع المتحولة (ETA)، عدد النمط الفرداني (h)، تنوع النمط الفرداني (Hd)، متوسط عدد اختلافات النيوكليوتيدات (k)، تنوع النيوكليوتيدات (Pi) كان 98 (S) 103 (ETA)، 9 (h)، 0.887±0.032 (Hd)، 25.789 (k) و 17.980x10-3 ±0.003 (Pi)، على التوالي (P < 0,05). يمثل ...