A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life hi...
Main Authors: | , , , , , , , , , , , , , , , |
---|---|
Format: | Text |
Language: | English |
Published: |
OpenAlex
2022
|
Subjects: | |
Online Access: | https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532 |
id |
ftdatacite:10.60692/fbg82-j4532 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftdatacite:10.60692/fbg82-j4532 2024-09-09T19:30:54+00:00 A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... Ruihua Zhang Qun Li Yingying Zhang Yating Qin Xiao Du Yongrui Lu Zengbao Yuan Yue Song Mengqi Zhang Kun Wang Shunping He Xin Liu Xun Xu Huanming Yang Inge Seim Guangyi Fan 2022 https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532 en eng OpenAlex https://dx.doi.org/10.60692/ffekv-kpt84 cc-by Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts Ecology FOS Biological sciences Environmental Science Physical Sciences Exosome Biology and Function in Intercellular Communication Physiological Adaptations Lungfish Gill Biology Vertebrate Extant taxon Zoology Evolutionary biology Fish Fishery Gene Genetics article-journal Text ScholarlyArticle 2022 ftdatacite https://doi.org/10.60692/fbg82-j453210.60692/ffekv-kpt84 2024-06-17T10:17:30Z Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life history strategy to survive dry periods in five lungfish species that can last for years, manifested by dormancy and reversible adaptive changes of the gills and lungs. Our atlas highlights the cell type diversity of the West African lungfish, including gene expression consistent with phenotype changes of terrestrialization. Comparisons with terrestrial tetrapods and ray-finned fishes revealed broad homology between the swim bladder and lung cell types and shared and idiosyncratic changes of the repressed, external gills of the West African lungfish and the internal gills of Atlantic salmon. The single-cell atlas presented here provides a valuable resource for further exploration of the evolution of the vertebrate ... : تمتلك الأنواع الستة من أسماك الرئة كلا من الرئتين والخياشيم وهي الأقرب إلى رباعيات الأرجل. هنا، نبلغ عن أطلس transcriptome أحادي الخلية لسمك الرئة في غرب إفريقيا ( Protopterus annectens ). يُظهر هذا النوع الشكل الأكثر تطرفًا للتربة، وهي استراتيجية لتاريخ الحياة للبقاء على قيد الحياة في الفترات الجافة في خمسة أنواع من الأسماك الرئوية التي يمكن أن تستمر لسنوات، والتي تتجلى في السكون والتغيرات التكيفية العكسية للخياشيم والرئتين. يسلط أطلسنا الضوء على تنوع أنواع الخلايا في أسماك الرئة في غرب إفريقيا، بما في ذلك التعبير الجيني المتوافق مع تغيرات النمط الظاهري للتربة. كشفت المقارنات مع رباعيات الأرجل الأرضية والأسماك ذات الزعانف الشعاعية عن تماثل واسع بين مثانة السباحة وأنواع خلايا الرئة والتغيرات المشتركة والخاصة للخياشيم الخارجية المكبوتة لسمك الرئة في غرب إفريقيا والخياشيم الداخلية لسمك السلمون الأطلسي. يوفر الأطلس أحادي الخلية المعروض هنا موردًا قيمًا لمزيد من الاستكشاف لتطور الجهاز التنفسي للفقاريات وتنوع تربة أسماك الرئة. ... Text Atlantic salmon DataCite |
institution |
Open Polar |
collection |
DataCite |
op_collection_id |
ftdatacite |
language |
English |
topic |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts Ecology FOS Biological sciences Environmental Science Physical Sciences Exosome Biology and Function in Intercellular Communication Physiological Adaptations Lungfish Gill Biology Vertebrate Extant taxon Zoology Evolutionary biology Fish Fishery Gene Genetics |
spellingShingle |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts Ecology FOS Biological sciences Environmental Science Physical Sciences Exosome Biology and Function in Intercellular Communication Physiological Adaptations Lungfish Gill Biology Vertebrate Extant taxon Zoology Evolutionary biology Fish Fishery Gene Genetics Ruihua Zhang Qun Li Yingying Zhang Yating Qin Xiao Du Yongrui Lu Zengbao Yuan Yue Song Mengqi Zhang Kun Wang Shunping He Xin Liu Xun Xu Huanming Yang Inge Seim Guangyi Fan A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
topic_facet |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts Ecology FOS Biological sciences Environmental Science Physical Sciences Exosome Biology and Function in Intercellular Communication Physiological Adaptations Lungfish Gill Biology Vertebrate Extant taxon Zoology Evolutionary biology Fish Fishery Gene Genetics |
description |
Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life history strategy to survive dry periods in five lungfish species that can last for years, manifested by dormancy and reversible adaptive changes of the gills and lungs. Our atlas highlights the cell type diversity of the West African lungfish, including gene expression consistent with phenotype changes of terrestrialization. Comparisons with terrestrial tetrapods and ray-finned fishes revealed broad homology between the swim bladder and lung cell types and shared and idiosyncratic changes of the repressed, external gills of the West African lungfish and the internal gills of Atlantic salmon. The single-cell atlas presented here provides a valuable resource for further exploration of the evolution of the vertebrate ... : تمتلك الأنواع الستة من أسماك الرئة كلا من الرئتين والخياشيم وهي الأقرب إلى رباعيات الأرجل. هنا، نبلغ عن أطلس transcriptome أحادي الخلية لسمك الرئة في غرب إفريقيا ( Protopterus annectens ). يُظهر هذا النوع الشكل الأكثر تطرفًا للتربة، وهي استراتيجية لتاريخ الحياة للبقاء على قيد الحياة في الفترات الجافة في خمسة أنواع من الأسماك الرئوية التي يمكن أن تستمر لسنوات، والتي تتجلى في السكون والتغيرات التكيفية العكسية للخياشيم والرئتين. يسلط أطلسنا الضوء على تنوع أنواع الخلايا في أسماك الرئة في غرب إفريقيا، بما في ذلك التعبير الجيني المتوافق مع تغيرات النمط الظاهري للتربة. كشفت المقارنات مع رباعيات الأرجل الأرضية والأسماك ذات الزعانف الشعاعية عن تماثل واسع بين مثانة السباحة وأنواع خلايا الرئة والتغيرات المشتركة والخاصة للخياشيم الخارجية المكبوتة لسمك الرئة في غرب إفريقيا والخياشيم الداخلية لسمك السلمون الأطلسي. يوفر الأطلس أحادي الخلية المعروض هنا موردًا قيمًا لمزيد من الاستكشاف لتطور الجهاز التنفسي للفقاريات وتنوع تربة أسماك الرئة. ... |
format |
Text |
author |
Ruihua Zhang Qun Li Yingying Zhang Yating Qin Xiao Du Yongrui Lu Zengbao Yuan Yue Song Mengqi Zhang Kun Wang Shunping He Xin Liu Xun Xu Huanming Yang Inge Seim Guangyi Fan |
author_facet |
Ruihua Zhang Qun Li Yingying Zhang Yating Qin Xiao Du Yongrui Lu Zengbao Yuan Yue Song Mengqi Zhang Kun Wang Shunping He Xin Liu Xun Xu Huanming Yang Inge Seim Guangyi Fan |
author_sort |
Ruihua Zhang |
title |
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
title_short |
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
title_full |
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
title_fullStr |
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
title_full_unstemmed |
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
title_sort |
single-cell transcriptome atlas of the west african lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... |
publisher |
OpenAlex |
publishDate |
2022 |
url |
https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532 |
genre |
Atlantic salmon |
genre_facet |
Atlantic salmon |
op_relation |
https://dx.doi.org/10.60692/ffekv-kpt84 |
op_rights |
cc-by |
op_doi |
https://doi.org/10.60692/fbg82-j453210.60692/ffekv-kpt84 |
_version_ |
1809899857651957760 |