A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...

Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life hi...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Ruihua Zhang, Qun Li, Yingying Zhang, Yating Qin, Xiao Du, Yongrui Lu, Zengbao Yuan, Yue Song, Mengqi Zhang, Kun Wang, Shunping He, Xin Liu, Xun Xu, Huanming Yang, Inge Seim, Guangyi Fan
Format: Text
Language:English
Published: OpenAlex 2022
Subjects:
Online Access:https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532
https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532
id ftdatacite:10.60692/fbg82-j4532
record_format openpolar
spelling ftdatacite:10.60692/fbg82-j4532 2024-09-09T19:30:54+00:00 A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ... Ruihua Zhang Qun Li Yingying Zhang Yating Qin Xiao Du Yongrui Lu Zengbao Yuan Yue Song Mengqi Zhang Kun Wang Shunping He Xin Liu Xun Xu Huanming Yang Inge Seim Guangyi Fan 2022 https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532 en eng OpenAlex https://dx.doi.org/10.60692/ffekv-kpt84 cc-by Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts Ecology FOS Biological sciences Environmental Science Physical Sciences Exosome Biology and Function in Intercellular Communication Physiological Adaptations Lungfish Gill Biology Vertebrate Extant taxon Zoology Evolutionary biology Fish Fishery Gene Genetics article-journal Text ScholarlyArticle 2022 ftdatacite https://doi.org/10.60692/fbg82-j453210.60692/ffekv-kpt84 2024-06-17T10:17:30Z Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life history strategy to survive dry periods in five lungfish species that can last for years, manifested by dormancy and reversible adaptive changes of the gills and lungs. Our atlas highlights the cell type diversity of the West African lungfish, including gene expression consistent with phenotype changes of terrestrialization. Comparisons with terrestrial tetrapods and ray-finned fishes revealed broad homology between the swim bladder and lung cell types and shared and idiosyncratic changes of the repressed, external gills of the West African lungfish and the internal gills of Atlantic salmon. The single-cell atlas presented here provides a valuable resource for further exploration of the evolution of the vertebrate ... : تمتلك الأنواع الستة من أسماك الرئة كلا من الرئتين والخياشيم وهي الأقرب إلى رباعيات الأرجل. هنا، نبلغ عن أطلس transcriptome أحادي الخلية لسمك الرئة في غرب إفريقيا ( Protopterus annectens ). يُظهر هذا النوع الشكل الأكثر تطرفًا للتربة، وهي استراتيجية لتاريخ الحياة للبقاء على قيد الحياة في الفترات الجافة في خمسة أنواع من الأسماك الرئوية التي يمكن أن تستمر لسنوات، والتي تتجلى في السكون والتغيرات التكيفية العكسية للخياشيم والرئتين. يسلط أطلسنا الضوء على تنوع أنواع الخلايا في أسماك الرئة في غرب إفريقيا، بما في ذلك التعبير الجيني المتوافق مع تغيرات النمط الظاهري للتربة. كشفت المقارنات مع رباعيات الأرجل الأرضية والأسماك ذات الزعانف الشعاعية عن تماثل واسع بين مثانة السباحة وأنواع خلايا الرئة والتغيرات المشتركة والخاصة للخياشيم الخارجية المكبوتة لسمك الرئة في غرب إفريقيا والخياشيم الداخلية لسمك السلمون الأطلسي. يوفر الأطلس أحادي الخلية المعروض هنا موردًا قيمًا لمزيد من الاستكشاف لتطور الجهاز التنفسي للفقاريات وتنوع تربة أسماك الرئة. ... Text Atlantic salmon DataCite
institution Open Polar
collection DataCite
op_collection_id ftdatacite
language English
topic Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Life Sciences
Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts
Ecology
FOS Biological sciences
Environmental Science
Physical Sciences
Exosome Biology and Function in Intercellular Communication
Physiological Adaptations
Lungfish
Gill
Biology
Vertebrate
Extant taxon
Zoology
Evolutionary biology
Fish
Fishery
Gene
Genetics
spellingShingle Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Life Sciences
Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts
Ecology
FOS Biological sciences
Environmental Science
Physical Sciences
Exosome Biology and Function in Intercellular Communication
Physiological Adaptations
Lungfish
Gill
Biology
Vertebrate
Extant taxon
Zoology
Evolutionary biology
Fish
Fishery
Gene
Genetics
Ruihua Zhang
Qun Li
Yingying Zhang
Yating Qin
Xiao Du
Yongrui Lu
Zengbao Yuan
Yue Song
Mengqi Zhang
Kun Wang
Shunping He
Xin Liu
Xun Xu
Huanming Yang
Inge Seim
Guangyi Fan
A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
topic_facet Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data
Molecular Biology
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Life Sciences
Metabolic Theory of Ecology and Climate Change Impacts
Ecology
FOS Biological sciences
Environmental Science
Physical Sciences
Exosome Biology and Function in Intercellular Communication
Physiological Adaptations
Lungfish
Gill
Biology
Vertebrate
Extant taxon
Zoology
Evolutionary biology
Fish
Fishery
Gene
Genetics
description Abstract The six species of lungfish possess both lungs and gills and are the closest extant relatives to tetrapods. Here, we report a single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish ( Protopterus annectens ). This species manifests the most extreme form of terrestrialization, a life history strategy to survive dry periods in five lungfish species that can last for years, manifested by dormancy and reversible adaptive changes of the gills and lungs. Our atlas highlights the cell type diversity of the West African lungfish, including gene expression consistent with phenotype changes of terrestrialization. Comparisons with terrestrial tetrapods and ray-finned fishes revealed broad homology between the swim bladder and lung cell types and shared and idiosyncratic changes of the repressed, external gills of the West African lungfish and the internal gills of Atlantic salmon. The single-cell atlas presented here provides a valuable resource for further exploration of the evolution of the vertebrate ... : تمتلك الأنواع الستة من أسماك الرئة كلا من الرئتين والخياشيم وهي الأقرب إلى رباعيات الأرجل. هنا، نبلغ عن أطلس transcriptome أحادي الخلية لسمك الرئة في غرب إفريقيا ( Protopterus annectens ). يُظهر هذا النوع الشكل الأكثر تطرفًا للتربة، وهي استراتيجية لتاريخ الحياة للبقاء على قيد الحياة في الفترات الجافة في خمسة أنواع من الأسماك الرئوية التي يمكن أن تستمر لسنوات، والتي تتجلى في السكون والتغيرات التكيفية العكسية للخياشيم والرئتين. يسلط أطلسنا الضوء على تنوع أنواع الخلايا في أسماك الرئة في غرب إفريقيا، بما في ذلك التعبير الجيني المتوافق مع تغيرات النمط الظاهري للتربة. كشفت المقارنات مع رباعيات الأرجل الأرضية والأسماك ذات الزعانف الشعاعية عن تماثل واسع بين مثانة السباحة وأنواع خلايا الرئة والتغيرات المشتركة والخاصة للخياشيم الخارجية المكبوتة لسمك الرئة في غرب إفريقيا والخياشيم الداخلية لسمك السلمون الأطلسي. يوفر الأطلس أحادي الخلية المعروض هنا موردًا قيمًا لمزيد من الاستكشاف لتطور الجهاز التنفسي للفقاريات وتنوع تربة أسماك الرئة. ...
format Text
author Ruihua Zhang
Qun Li
Yingying Zhang
Yating Qin
Xiao Du
Yongrui Lu
Zengbao Yuan
Yue Song
Mengqi Zhang
Kun Wang
Shunping He
Xin Liu
Xun Xu
Huanming Yang
Inge Seim
Guangyi Fan
author_facet Ruihua Zhang
Qun Li
Yingying Zhang
Yating Qin
Xiao Du
Yongrui Lu
Zengbao Yuan
Yue Song
Mengqi Zhang
Kun Wang
Shunping He
Xin Liu
Xun Xu
Huanming Yang
Inge Seim
Guangyi Fan
author_sort Ruihua Zhang
title A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
title_short A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
title_full A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
title_fullStr A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
title_full_unstemmed A single-cell transcriptome atlas of the West African lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
title_sort single-cell transcriptome atlas of the west african lungfish highlights the respiratory evolution of a fish adapted to water and land ... : يسلط أطلس نسخي أحادي الخلية لأسماك الرئة في غرب إفريقيا الضوء على التطور التنفسي للأسماك المتكيفة مع المياه والأرض ...
publisher OpenAlex
publishDate 2022
url https://dx.doi.org/10.60692/fbg82-j4532
https://gresis.osc.int//doi/10.60692/fbg82-j4532
genre Atlantic salmon
genre_facet Atlantic salmon
op_relation https://dx.doi.org/10.60692/ffekv-kpt84
op_rights cc-by
op_doi https://doi.org/10.60692/fbg82-j453210.60692/ffekv-kpt84
_version_ 1809899857651957760