Transcriptional and biochemical analyses of Planomicrobium strain AX6 from Qinghai-Tibetan Plateau, China, reveal hydrogen peroxide scavenging potential ... : تكشف التحليلات النصية والكيميائية الحيوية لسلالة بلانوميكروبيوم AX6 من هضبة تشينغهاي التبتية، الصين، عن إمكانية كسح بيروكسيد الهيدروجين ...

• Main Authors: Ali Bahadur, Ting Li, Wasim Sajjad, Fahad Nasir, Muhammad Amir Zia, Minghui Wu, Gaosen Zhang, Guangxiu Liu, Tuo Chen, Wei Wang
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2022
• Subjects: Marine Microbial Diversity and Biogeography; Ecology; FOS Biological sciences; Environmental Science; Physical Sciences; Advances in Metabolomics Research; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Microbial Diversity in Antarctic Ecosystems; Climate Change; Biology; Strain injury; Oxidative stress; KEGG; Scavenging; Gene; Hydrogen peroxide; Superoxide dismutase; Antioxidant; Biochemistry; Gene expression; Genetics; Transcriptome; Anatomy; Antarc*; Antarctic
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/c3n1m-kwc45; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/c3n1m-kwc45

Abstract Background The bacterial mechanisms responsible for hydrogen peroxide (H 2 O 2 ) scavenging have been well-reported, yet little is known about how bacteria isolated from cold-environments respond to H 2 O 2 stress. Therefore, we investigated the transcriptional profiling of the Planomicrobium strain AX6 strain isolated from the cold-desert ecosystem in the Qaidam Basin, Qinghai-Tibet Plateau, China, in response to H 2 O 2 stress aiming to uncover the molecular mechanisms associated with H 2 O 2 scavenging potential. Methods We investigated the H 2 O 2 -scavenging potential of the bacterial Planomicrobium strain AX6 isolated from the cold-desert ecosystem in the Qaidam Basin, Qinghai-Tibet Plateau, China. Furthermore, we used high-throughput RNA-sequencing to unravel the molecular aspects associated with the H 2 O 2 scavenging potential of the Planomicrobium strain AX6 isolate. Results In total, 3,427 differentially expressed genes (DEGs) were identified in Planomicrobium strain AX6 isolate in ... : خلفية مجردة تم الإبلاغ جيدًا عن الآليات البكتيرية المسؤولة عن كسح بيروكسيد الهيدروجين (H 2 O 2 )، ومع ذلك لا يُعرف سوى القليل عن كيفية استجابة البكتيريا المعزولة عن البيئات الباردة لإجهاد H 2 O 2. لذلك، قمنا بالتحقيق في التنميط النصي لسلالة بلانوميكروبيوم AX6 المعزولة من النظام البيئي الصحراوي البارد في حوض القاعدة، هضبة تشينغهاي- التبت، الصين، استجابةً لإجهاد H 2 O 2 الذي يهدف إلى الكشف عن الآليات الجزيئية المرتبطة بإمكانية كسح H 2 O 2. الطرق التي حققنا فيها في إمكانات مسح H 2 O 2 لسلالة Planomicrobium البكتيرية AX 6 المعزولة عن النظام البيئي الصحراوي البارد في حوض Qaidam، هضبة Qinghai - Tibet، الصين. علاوة على ذلك، استخدمنا تسلسل الحمض النووي الريبي عالي الإنتاجية لكشف الجوانب الجزيئية المرتبطة بإمكانية كسح H 2 O 2 لسلالة Planomicrobium AX 6 المعزولة. النتائج في المجموع، تم تحديد 3427 من الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي (DEGs) في سلالة بلانوميكروبيوم AX6 المعزولة استجابةً لتعرض 4 ساعات من H 2 O 2 (1.5 مم). إلى جانب ذلك، كشفت موسوعة كيوتو للجينات ومسار الجينوم وتحليلات علم الوجود الجيني عن المسارات السفلية ...