Indentification and determination of toxin genes of Vibrio strains caused hemorrhagic disease on red drum (Sciaenops ocellatus) by PCR method ... : تسبب تحديد وتحديد الجينات السامة لسلالات الضمة في حدوث مرض نزفي على الأسطوانة الحمراء (Sciaenops ocellatus) بواسطة PCR الطريقة ...

• Main Authors: Nguyen Quang Linh, Phạm Thị Hải Yến, Nguyễn Duy Quỳnh Trâm
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2020
• Subjects: Dynamics and Pathogenesis of Cholera Bacteria; Endocrinology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Plant Responses to Flooding Stress; Plant Science; Agricultural and Biological Sciences; Vibrio cholerae; Vibrio alginolyticus; Biology; 16S ribosomal RNA; Vibrio; Phylogenetic tree; Nucleotide diversity; Microbiology; FOS Biological sciences; Toxin; Haplotype; Population; Genetic diversity; Bacteria; Genotype; Gene; Genetics; Demography; FOS Sociology; Sociology; Red drum; Sciaenops ocellatus
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/bkvsf-n6v87; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/bkvsf-n6v87

Abstract In this study, we isolated thirty strains of Vibrio from three different organs (brain, hemorrhagic site and digestive system) of Sciaenops ocellatus disease. The results showed that nucleotide sequences 16S rRNA region are highly, similar to those of V. alginolyticus, V. azureus, V. fluvialis and V. orientalis is published on Genebank, ranging from 98.05 to 100 %. The digestive system has the most common Vibrio strains (V. alginolyticus, V. azureus and V. fluvialis). Thereout, We found 25/30 strains of Vibrio containing from 1 to 3 toxin genes. None of V. parahaemolyticus present. Six parameters were used to measure the DNA polymorphism of thirty-three homologous DNA sequences in this Vibrio bacteria population. The results indicated that, number of separate polymorphic sites (S), total number of mutant sites (Eta), number of haplotype (h), haplotype diversity (Hd), average number of nucleotide differences (k), nucleotide diversity (Pi) were 98 (S) 103 (Eta), 9 (h), 0.887±0.032 (Hd), 25.789 (k) and ... : الملخص في هذه الدراسة، قمنا بعزل ثلاثين سلالة من الضمة من ثلاثة أعضاء مختلفة (الدماغ والموقع النزفي والجهاز الهضمي) من مرض سينوبس أوسيلاتوس. أظهرت النتائج أن متواليات النوكليوتيدات 16S منطقة الحمض النووي الريبوزي الريبوزي عالية، مماثلة لتلك الخاصة بـ V. alginolyticus، V. azureus، V. fluvialis و V. orientalis يتم نشرها على بنك الجينات، تتراوح من 98.05 إلى 100 ٪. يحتوي الجهاز الهضمي على سلالات الضمة الأكثر شيوعًا (V. alginolyticus و V. azureus و V. fluvialis). هناك، وجدنا 25/30 سلالات من الضمة تحتوي على 1 إلى 3 جينات سامة. لا يوجد أي من V. parahaemolyticus. تم استخدام ستة معلمات لقياس تعدد أشكال الحمض النووي لثلاثة وثلاثين تسلسلًا من الحمض النووي المتماثل في مجموعة بكتيريا الضمة هذه. أشارت النتائج إلى أن عدد المواقع المنفصلة متعددة الأشكال (S)، إجمالي عدد المواقع المتحولة (ETA)، عدد النمط الفرداني (h)، تنوع النمط الفرداني (Hd)، متوسط عدد اختلافات النيوكليوتيدات (k)، تنوع النيوكليوتيدات (Pi) كان 98 (S) 103 (ETA)، 9 (h)، 0.887±0.032 (Hd)، 25.789 (k) و 17.980x10-3 ±0.003 (Pi)، على التوالي (P < 0,05). محتوى G+C ...