High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ...
The wax ester (WE) and triacylglycerol (TAG) biosynthetic potential of marine microorganisms is poorly understood at the microbial community level. The goal of this work was to uncover the prevalence and diversity of bacteria with the potential to synthesize these neutral lipids in coastal sediments...
Main Authors: | , , , , , , , , , |
---|---|
Format: | Text |
Language: | English |
Published: |
OpenAlex
2023
|
Subjects: | |
Online Access: | https://dx.doi.org/10.60692/bhmj2-x2679 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/bhmj2-x2679 |
id |
ftdatacite:10.60692/bhmj2-x2679 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftdatacite:10.60692/bhmj2-x2679 2024-09-15T17:47:10+00:00 High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... Virginia Galván Federico Pascutti Natalia Sandoval Mariana P. Lanfranconi Mariana Lozada Ana Arabolaza Walter P. Mac Cormack Héctor M. Álvarez Hugo Gramajo Hebe M. Dionisi 2023 https://dx.doi.org/10.60692/bhmj2-x2679 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/bhmj2-x2679 en eng OpenAlex https://dx.doi.org/10.60692/9bdyz-3p927 cc-by Metabolic Engineering and Synthetic Biology Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Advances in Metabolomics Research Mass Spectrometry Techniques with Proteins Spectroscopy Chemistry Physical Sciences Microbial Metabolism Biology Context archaeology Intertidal zone Wax ester Metagenomics Ecology FOS Biological sciences Biochemistry Wax Gene Paleontology Text ScholarlyArticle article-journal 2023 ftdatacite https://doi.org/10.60692/bhmj2-x267910.60692/9bdyz-3p927 2024-08-01T11:07:27Z The wax ester (WE) and triacylglycerol (TAG) biosynthetic potential of marine microorganisms is poorly understood at the microbial community level. The goal of this work was to uncover the prevalence and diversity of bacteria with the potential to synthesize these neutral lipids in coastal sediments of two high latitude environments, and to characterize the gene clusters related to this process. Homolog sequences of the key enzyme, the wax ester synthase/acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT) were retrieved from 13 metagenomes, including subtidal and intertidal sediments of a Subantarctic environment (Ushuaia Bay, Argentina), and subtidal sediments of an Antarctic environment (Potter Cove, Antarctica). The abundance of WS/DGAT homolog sequences in the sediment metagenomes was 1.23 ± 0.42 times the abundance of 12 single-copy genes encoding ribosomal proteins, higher than in seawater (0.13 ± 0.31 times in 338 metagenomes). Homolog sequences were highly diverse, and were assigned to the ... : إن إمكانات التخليق الحيوي لإستر الشمع (WE) و triacylglycerol (TAG) للكائنات الحية الدقيقة البحرية غير مفهومة بشكل جيد على مستوى المجتمع الميكروبي. كان الهدف من هذا العمل هو الكشف عن انتشار وتنوع البكتيريا مع القدرة على توليف هذه الدهون المحايدة في الرواسب الساحلية في بيئتين خطي عرض عاليين، وتوصيف مجموعات الجينات المتعلقة بهذه العملية. تم استرداد التسلسلات المتماثلة للإنزيم الرئيسي، سينسيز إستر الشمع/أسيل- CoA: ثنائي أسيل جليسرول أسيل ترانسفيراز (WS/DGAT) من 13 ميتاجينوم، بما في ذلك الرواسب تحت المد والجزر لبيئة تحت القطب الجنوبي (خليج أوشوايا، الأرجنتين)، والرواسب تحت المد لبيئة القطب الجنوبي (بوتر كوف، القارة القطبية الجنوبية). بلغت وفرة متواليات متجانسات WS/DGAT في ميتاجينوم الرواسب 1.23 ± 0.42 ضعف وفرة 12 جينًا أحادي النسخة تشفر البروتينات الريبوسومية، أعلى من مياه البحر (0.13 ± 0.31 مرة في 338 ميتاجينوم). كانت التسلسلات المتماثلة متنوعة للغاية، وتم تعيينها إلى Pseudomonadota و Actinomycetota و Bacteroidota و Acidobacteriota phyla. تضمن السياق الجيني لمتجانسات WS/DGAT التسلسلات المتعلقة بمسارات التخليق ... Text Antarc* Antarctic Antarctica DataCite |
institution |
Open Polar |
collection |
DataCite |
op_collection_id |
ftdatacite |
language |
English |
topic |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Advances in Metabolomics Research Mass Spectrometry Techniques with Proteins Spectroscopy Chemistry Physical Sciences Microbial Metabolism Biology Context archaeology Intertidal zone Wax ester Metagenomics Ecology FOS Biological sciences Biochemistry Wax Gene Paleontology |
spellingShingle |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Advances in Metabolomics Research Mass Spectrometry Techniques with Proteins Spectroscopy Chemistry Physical Sciences Microbial Metabolism Biology Context archaeology Intertidal zone Wax ester Metagenomics Ecology FOS Biological sciences Biochemistry Wax Gene Paleontology Virginia Galván Federico Pascutti Natalia Sandoval Mariana P. Lanfranconi Mariana Lozada Ana Arabolaza Walter P. Mac Cormack Héctor M. Álvarez Hugo Gramajo Hebe M. Dionisi High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
topic_facet |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology Molecular Biology Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Life Sciences Advances in Metabolomics Research Mass Spectrometry Techniques with Proteins Spectroscopy Chemistry Physical Sciences Microbial Metabolism Biology Context archaeology Intertidal zone Wax ester Metagenomics Ecology FOS Biological sciences Biochemistry Wax Gene Paleontology |
description |
The wax ester (WE) and triacylglycerol (TAG) biosynthetic potential of marine microorganisms is poorly understood at the microbial community level. The goal of this work was to uncover the prevalence and diversity of bacteria with the potential to synthesize these neutral lipids in coastal sediments of two high latitude environments, and to characterize the gene clusters related to this process. Homolog sequences of the key enzyme, the wax ester synthase/acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT) were retrieved from 13 metagenomes, including subtidal and intertidal sediments of a Subantarctic environment (Ushuaia Bay, Argentina), and subtidal sediments of an Antarctic environment (Potter Cove, Antarctica). The abundance of WS/DGAT homolog sequences in the sediment metagenomes was 1.23 ± 0.42 times the abundance of 12 single-copy genes encoding ribosomal proteins, higher than in seawater (0.13 ± 0.31 times in 338 metagenomes). Homolog sequences were highly diverse, and were assigned to the ... : إن إمكانات التخليق الحيوي لإستر الشمع (WE) و triacylglycerol (TAG) للكائنات الحية الدقيقة البحرية غير مفهومة بشكل جيد على مستوى المجتمع الميكروبي. كان الهدف من هذا العمل هو الكشف عن انتشار وتنوع البكتيريا مع القدرة على توليف هذه الدهون المحايدة في الرواسب الساحلية في بيئتين خطي عرض عاليين، وتوصيف مجموعات الجينات المتعلقة بهذه العملية. تم استرداد التسلسلات المتماثلة للإنزيم الرئيسي، سينسيز إستر الشمع/أسيل- CoA: ثنائي أسيل جليسرول أسيل ترانسفيراز (WS/DGAT) من 13 ميتاجينوم، بما في ذلك الرواسب تحت المد والجزر لبيئة تحت القطب الجنوبي (خليج أوشوايا، الأرجنتين)، والرواسب تحت المد لبيئة القطب الجنوبي (بوتر كوف، القارة القطبية الجنوبية). بلغت وفرة متواليات متجانسات WS/DGAT في ميتاجينوم الرواسب 1.23 ± 0.42 ضعف وفرة 12 جينًا أحادي النسخة تشفر البروتينات الريبوسومية، أعلى من مياه البحر (0.13 ± 0.31 مرة في 338 ميتاجينوم). كانت التسلسلات المتماثلة متنوعة للغاية، وتم تعيينها إلى Pseudomonadota و Actinomycetota و Bacteroidota و Acidobacteriota phyla. تضمن السياق الجيني لمتجانسات WS/DGAT التسلسلات المتعلقة بمسارات التخليق ... |
format |
Text |
author |
Virginia Galván Federico Pascutti Natalia Sandoval Mariana P. Lanfranconi Mariana Lozada Ana Arabolaza Walter P. Mac Cormack Héctor M. Álvarez Hugo Gramajo Hebe M. Dionisi |
author_facet |
Virginia Galván Federico Pascutti Natalia Sandoval Mariana P. Lanfranconi Mariana Lozada Ana Arabolaza Walter P. Mac Cormack Héctor M. Álvarez Hugo Gramajo Hebe M. Dionisi |
author_sort |
Virginia Galván |
title |
High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
title_short |
High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
title_full |
High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
title_fullStr |
High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
title_full_unstemmed |
High wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of Antarctic and Subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
title_sort |
high wax ester and triacylglycerol biosynthesis potential in coastal sediments of antarctic and subantarctic environments ... : إمكانات تخليق حيوي عالية لإستر الشمع وترياسيل جليسرول في الرواسب الساحلية في بيئات أنتاركتيكا وشبه أنتاركتيكا ... |
publisher |
OpenAlex |
publishDate |
2023 |
url |
https://dx.doi.org/10.60692/bhmj2-x2679 https://gresis.osc.int//doi/10.60692/bhmj2-x2679 |
genre |
Antarc* Antarctic Antarctica |
genre_facet |
Antarc* Antarctic Antarctica |
op_relation |
https://dx.doi.org/10.60692/9bdyz-3p927 |
op_rights |
cc-by |
op_doi |
https://doi.org/10.60692/bhmj2-x267910.60692/9bdyz-3p927 |
_version_ |
1810495935204032512 |