Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region
Цианопрокариоты (цианобактерии) являются одними из наиболее распространённых фототрофов в Арктике. Простая морфология в сочетании с экологической пластичностью затрудняет идентификацию организмов на основе только анатомических и морфологических признаков. Использование альгологически чистых культур...
Published in: | Theoretical and Applied Ecology |
---|---|
Main Authors: | , , , , |
Format: | Article in Journal/Newspaper |
Language: | unknown |
Published: |
Theoretical and Applied Ecology
2020
|
Subjects: | |
Online Access: | https://dx.doi.org/10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 http://envjournal.ru/ari/v2020/v1/20117.pdf |
id |
ftdatacite:10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftdatacite:10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 2023-05-15T14:54:30+02:00 Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region Давыдов, Д.А. Патова, Е.Н. Шалыгин, С.С. Вильнет, А.А. Новаковская, И.В. 2020 https://dx.doi.org/10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 http://envjournal.ru/ari/v2020/v1/20117.pdf unknown Theoretical and Applied Ecology DataPaper CreativeWork article 2020 ftdatacite https://doi.org/10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 2021-11-05T12:55:41Z Цианопрокариоты (цианобактерии) являются одними из наиболее распространённых фототрофов в Арктике. Простая морфология в сочетании с экологической пластичностью затрудняет идентификацию организмов на основе только анатомических и морфологических признаков. Использование альгологически чистых культур и проведение молекулярно-генетических анализов позволяет выявлять скрытое разнообразие и криптические виды цианобактерий. В настоящем исследовании проведено изучение ряда трудно идентифицируемых штаммов, выделенных из арктических и горно-тундровых почв, из коллекций Института биологии Коми НЦ (SYKOA) и Полярно-альпийского ботанического сада-института (KPABG). Анализируемые штаммы обладают довольно простым строением и по морфологическим признакам относятся к Leptolyngbya s.l. Использование анализа нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК и внутреннего спейсера 16S-23S ITS позволило уточнить их родовую принадлежность. Показано, что штаммы Stenomitos sp. SYKOA-C-003-10, Nodosilinea sp. KPABG-3220 и Droutiella sp. SYKOA-C-002-10 являются потенциальными новыми видами : Cyanobacteria are the most abundant photosynthetic organisms in the Arctic. A simple morphology with a few diagnostics features, together with ecological plasticity complicate their species identification. The use of unialgal cultures with subsequent molecular analyses could reveal cryptic diversity of some cyanobacteria taxa. In this article, we studied a number of difficult-to-identify strains of cyanobacteria isolated from the Arctic (Svalbard archipelago) and mountain-tundras (Khibiny and Subpolar Urals) from terrestrial and near-water habitats. The strains are stored in the collections of cyanobacteria of the Institute of Biology of the Komi Scientific Center (SYKOA) and the Polar-Alpine Botanical Garden Institute (KPABG). The article gives the morphological characteristics of the studied strains: the size of the filaments, the shape of trichomes, the presence of nodules and necridic cells, the form of terminal cells. The studied strains of cyanobacteria were characterized by similar morphological structures. Their reliable identification only on the basis of morphology was impossible. The analyzed strains have a fairly simple structure and according to morphological characteristics belong to Leptolyngbya s.l. Exploring strains were tested using nucleotide sequence data of 16S rRNA and 16S-23S ITS. This made it possible to clarify their genus affiliation. Stenomitos sp. SYKOA-C-003-10, Nodosilinea sp. KPABG-3220, and Droutiella sp. SYKOA-C-002-10 appear to be new for science species gathered in high Arctic. Article in Journal/Newspaper Arctic Svalbard DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology) Arctic Khibiny ENVELOPE(33.210,33.210,67.679,67.679) Svalbard Svalbard Archipelago Theoretical and Applied Ecology 1 110 116 |
institution |
Open Polar |
collection |
DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology) |
op_collection_id |
ftdatacite |
language |
unknown |
description |
Цианопрокариоты (цианобактерии) являются одними из наиболее распространённых фототрофов в Арктике. Простая морфология в сочетании с экологической пластичностью затрудняет идентификацию организмов на основе только анатомических и морфологических признаков. Использование альгологически чистых культур и проведение молекулярно-генетических анализов позволяет выявлять скрытое разнообразие и криптические виды цианобактерий. В настоящем исследовании проведено изучение ряда трудно идентифицируемых штаммов, выделенных из арктических и горно-тундровых почв, из коллекций Института биологии Коми НЦ (SYKOA) и Полярно-альпийского ботанического сада-института (KPABG). Анализируемые штаммы обладают довольно простым строением и по морфологическим признакам относятся к Leptolyngbya s.l. Использование анализа нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК и внутреннего спейсера 16S-23S ITS позволило уточнить их родовую принадлежность. Показано, что штаммы Stenomitos sp. SYKOA-C-003-10, Nodosilinea sp. KPABG-3220 и Droutiella sp. SYKOA-C-002-10 являются потенциальными новыми видами : Cyanobacteria are the most abundant photosynthetic organisms in the Arctic. A simple morphology with a few diagnostics features, together with ecological plasticity complicate their species identification. The use of unialgal cultures with subsequent molecular analyses could reveal cryptic diversity of some cyanobacteria taxa. In this article, we studied a number of difficult-to-identify strains of cyanobacteria isolated from the Arctic (Svalbard archipelago) and mountain-tundras (Khibiny and Subpolar Urals) from terrestrial and near-water habitats. The strains are stored in the collections of cyanobacteria of the Institute of Biology of the Komi Scientific Center (SYKOA) and the Polar-Alpine Botanical Garden Institute (KPABG). The article gives the morphological characteristics of the studied strains: the size of the filaments, the shape of trichomes, the presence of nodules and necridic cells, the form of terminal cells. The studied strains of cyanobacteria were characterized by similar morphological structures. Their reliable identification only on the basis of morphology was impossible. The analyzed strains have a fairly simple structure and according to morphological characteristics belong to Leptolyngbya s.l. Exploring strains were tested using nucleotide sequence data of 16S rRNA and 16S-23S ITS. This made it possible to clarify their genus affiliation. Stenomitos sp. SYKOA-C-003-10, Nodosilinea sp. KPABG-3220, and Droutiella sp. SYKOA-C-002-10 appear to be new for science species gathered in high Arctic. |
format |
Article in Journal/Newspaper |
author |
Давыдов, Д.А. Патова, Е.Н. Шалыгин, С.С. Вильнет, А.А. Новаковская, И.В. |
spellingShingle |
Давыдов, Д.А. Патова, Е.Н. Шалыгин, С.С. Вильнет, А.А. Новаковская, И.В. Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
author_facet |
Давыдов, Д.А. Патова, Е.Н. Шалыгин, С.С. Вильнет, А.А. Новаковская, И.В. |
author_sort |
Давыдов, Д.А. |
title |
Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
title_short |
Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
title_full |
Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
title_fullStr |
Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
title_full_unstemmed |
Проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : The problem of Cyanobacteria cryptic speciation in the Arctic region |
title_sort |
проблема скрытого разнообразия цианопрокариот арктических территорий : the problem of cyanobacteria cryptic speciation in the arctic region |
publisher |
Theoretical and Applied Ecology |
publishDate |
2020 |
url |
https://dx.doi.org/10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 http://envjournal.ru/ari/v2020/v1/20117.pdf |
long_lat |
ENVELOPE(33.210,33.210,67.679,67.679) |
geographic |
Arctic Khibiny Svalbard Svalbard Archipelago |
geographic_facet |
Arctic Khibiny Svalbard Svalbard Archipelago |
genre |
Arctic Svalbard |
genre_facet |
Arctic Svalbard |
op_doi |
https://doi.org/10.25750/1995-4301-2020-1-110-116 |
container_title |
Theoretical and Applied Ecology |
container_issue |
1 |
container_start_page |
110 |
op_container_end_page |
116 |
_version_ |
1766326214225559552 |