Modelling the response of Antarctic marine species to environmental changes. Methods, applications and limitations ... : Modéliser la réponse des espèces marines antarctiques aux changements environnementaux. Méthodes, applications et limites ...

• Main Authors: Laboratoire Biogéosciences UMR 6282, Guillaumot, Charlène
• Format: Dataset
• Language: English
• Published: GitHub 2021
• Subjects: ecology; écologie; marine & freshwater biology; biologie marine - hydrobiologie; oceanography; océanographie; environmental sciences; sciences de l'environnement; Boosted Regression Tree BRT; arbre de décision; presence-only; présence seule; cross validation; validation croisée; extrapolation; modelling evaluation; évaluation de la performance de la modélisation; Southern Ocean; Océan Austral; marine benthic species; espèces benthiques marines; name=Océan Austral;projection=WGS84;northlimit=-45;units=°; start=2017;end=2021; Abatus cordatus; Acodontaster hodgsoni; Bathybiaster loripes; Glabraster antarctica; Halicarcinus planatus; Labidiaster annulatus; Odontaster validus; Psilaster charcoti; Antarctic; Austral; Antarc*; Antarctica; Antarctique*
• Online Access: https://dx.doi.org/10.25666/dataosu-2021-11-09; https://search-data.ubfc.fr/FR-18008901306731-2021-11-09_Modelling-the-response-of-Antarctic-marine.html

Ecological modelling is nowadays widely used to highlight the environmental conditions that influence the species ecological niche and better understand their response to environmental changes. Methodological challenges are however present for Southern Ocean marine case studies and it is important to evaluate the performance and limits of such models. In this PhD thesis, several examples allow studying physiological models that simulate the influence of the environment on individual metabolism distribution models that study the relationship between species presence records and the environment and dispersal models that predict the drift of propagules in water masses. From these analyses, an ensemble of methodological guidelines were provided, to complement R scripts and tutorials that allow to correct for the different biases and improve modelling performance. Modelling marine Southern Ocean case studies is possible, but requires numerous cautions and further data to improve model evaluation procedures. ... : La modélisation écologique est aujourd’hui très utilisée pour mettre en avant les facteurs qui influencent la niche écologique des espèces et mieux comprendre leur réponse face aux changements environnementaux. Des défis méthodologiques se lèvent cependant devant des applications à des espèces marines antarctiques et il est important de pouvoir évaluer la performance et les limites de ces modèles. Dans cette thèse, des exemples ont permis de s’intéresser aux modèles physiologiques qui simulent l’influence de l’environnement sur le métabolisme des individus aux modèles de distribution qui étudient la relation entre la présence de l’espèce et l’environnement et aux modèles de dispersion qui prédisent le mouvement de propagules dans les masses d’eau. A l’issue de ces analyses, un ensemble de conseils méthodologiques ont été apportés, en complément de scripts R et tutoriels pour adapter les modèles aux différents biais et améliorer leur performance. Modéliser des cas d’étude marins antarctiques est possible, ...