Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК

Виды рода Rhodiola L. популярные лекарственные растения, исторически используются в качестве адаптогенов и являются категорией особо уязвимой вследствие интенсивной, нерациональной, недостаточно контролируемой заготовки сырья. Кроме того, естественные процессы (аридизация и потепление климата) также...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Козыренко М.М., Артюкова Е.В., Позднякова Т.Э.
Format: Report
Language:unknown
Published: Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета 2018
Subjects:
Online Access:https://dx.doi.org/10.24411/2078-1318-2018-11047
https://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskoe-raznoobrazie-vidov-rhodiola-r-rosea-r-integrifolia-r-stephanii-i-r-pinnatifida-po-dannym-polimorfizma-mezhgennyh-speyserov/pdf
id ftdatacite:10.24411/2078-1318-2018-11047
record_format openpolar
spelling ftdatacite:10.24411/2078-1318-2018-11047 2023-05-15T16:59:15+02:00 Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК Козыренко М.М. Артюкова Е.В. Позднякова Т.Э. 2018 https://dx.doi.org/10.24411/2078-1318-2018-11047 https://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskoe-raznoobrazie-vidov-rhodiola-r-rosea-r-integrifolia-r-stephanii-i-r-pinnatifida-po-dannym-polimorfizma-mezhgennyh-speyserov/pdf unknown Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета RHODIOLA ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ МЕЖГЕННЫЕ СПЕЙСЕРЫ ХЛОРОПЛАСТНАЯ ДНК GENETIC VARIABILITY INTERGENIC SPACERS CHLOROPLAST DNA Paper Text article-journal ScholarlyArticle 2018 ftdatacite https://doi.org/10.24411/2078-1318-2018-11047 2021-11-05T12:55:41Z Виды рода Rhodiola L. популярные лекарственные растения, исторически используются в качестве адаптогенов и являются категорией особо уязвимой вследствие интенсивной, нерациональной, недостаточно контролируемой заготовки сырья. Кроме того, естественные процессы (аридизация и потепление климата) также оказывают неблагоприятное воздействие на состояние природных популяций. Для оценки жизнеспособности и адаптивного потенциала вида в меняющихся условиях среды, для разработки стратегии его сохранения необходимы знания о генетическом разнообразии природных популяций. Анализ изменчивости нуклеотидных последовательностей межгенных спейсеров atpB-rbcL и trnS-trnG хлоропластной ДНК у Rhodiola rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida показал, что популяции R. rosea, кроме камчатской, и R. pinnatifida характеризуются средними уровнями гаплотипического (0,533-0,786) и нуклеотидного (0,0004-0,0143) разнообразия. Камчатские популяции R. rosea и R. integrifolia и популяции R. stephanii оказались мономорфными, что может быть следствием прохождения популяций в своей истории через "бутылочное горлышко". В целом вид R. rosea характеризуется достаточно высоким уровнем генетического разнообразия (h = 0,795; π = 0,0137), значительной межпопуляционной дифференциацией (ΦST = 0,74725; P <0,0001) и слабым генным потоком (Nm = 0,23). Филогенетические анализы показали, что забайкальская популяция, растения которой были определены как R. pinnatifida, является, по-видимому, R. rosea или ее внутривидовым таксоном. Таким образом, чтобы гарантированно охватить все разнообразие, необходима целенаправленная защита всех природных популяций Rhodiola.Species of the genus Rhodiola are popular medicinal plants, historically used as adaptogens and are a category particularly vulnerable due to intensive, irrational, under-controlled raw material procurement. To assess the viability and adaptive potential of a species under changing environmental conditions (aridization and warming of the climate), and to development of a conservation strategy requires knowledge of the genetic diversity of natural populations. Analysis of the nucleotide sequences of the atpB-rbcL and trnS-trnG intergenic spacers of chloroplast DNA in Rhodiola rosea, R. integrifolia, R. stephanii and R. pinnatifida showed that the populations of R. rosea, except Kamchatka, and R. pinnatifida were characterized by an average level of haplotype and nucleotide diversity. Kamchatka populations of R. rosea and R. integrifolia, and populations of R. stephanii were monomorphic that could be interpreted as a consequence of bottleneck in their evolutionary histories. In general, R. rosea is characterized by sufficiently high levels of genetic diversity and interpopulation differentiation and a weak gene flow. Phylogenetic analyzes showed that the Transbaikalian population, whose plants were identified as R. pinnatifida, is apparently R. rosea or its intraspecific taxon. For the conservation of genetic diversity it is purposefully necessary to protect all natural Rhodiola populations. Report Kamchatka DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology)
institution Open Polar
collection DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology)
op_collection_id ftdatacite
language unknown
topic RHODIOLA
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ
МЕЖГЕННЫЕ СПЕЙСЕРЫ
ХЛОРОПЛАСТНАЯ ДНК
GENETIC VARIABILITY
INTERGENIC SPACERS
CHLOROPLAST DNA
spellingShingle RHODIOLA
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ
МЕЖГЕННЫЕ СПЕЙСЕРЫ
ХЛОРОПЛАСТНАЯ ДНК
GENETIC VARIABILITY
INTERGENIC SPACERS
CHLOROPLAST DNA
Козыренко М.М.
Артюкова Е.В.
Позднякова Т.Э.
Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
topic_facet RHODIOLA
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ
МЕЖГЕННЫЕ СПЕЙСЕРЫ
ХЛОРОПЛАСТНАЯ ДНК
GENETIC VARIABILITY
INTERGENIC SPACERS
CHLOROPLAST DNA
description Виды рода Rhodiola L. популярные лекарственные растения, исторически используются в качестве адаптогенов и являются категорией особо уязвимой вследствие интенсивной, нерациональной, недостаточно контролируемой заготовки сырья. Кроме того, естественные процессы (аридизация и потепление климата) также оказывают неблагоприятное воздействие на состояние природных популяций. Для оценки жизнеспособности и адаптивного потенциала вида в меняющихся условиях среды, для разработки стратегии его сохранения необходимы знания о генетическом разнообразии природных популяций. Анализ изменчивости нуклеотидных последовательностей межгенных спейсеров atpB-rbcL и trnS-trnG хлоропластной ДНК у Rhodiola rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida показал, что популяции R. rosea, кроме камчатской, и R. pinnatifida характеризуются средними уровнями гаплотипического (0,533-0,786) и нуклеотидного (0,0004-0,0143) разнообразия. Камчатские популяции R. rosea и R. integrifolia и популяции R. stephanii оказались мономорфными, что может быть следствием прохождения популяций в своей истории через "бутылочное горлышко". В целом вид R. rosea характеризуется достаточно высоким уровнем генетического разнообразия (h = 0,795; π = 0,0137), значительной межпопуляционной дифференциацией (ΦST = 0,74725; P <0,0001) и слабым генным потоком (Nm = 0,23). Филогенетические анализы показали, что забайкальская популяция, растения которой были определены как R. pinnatifida, является, по-видимому, R. rosea или ее внутривидовым таксоном. Таким образом, чтобы гарантированно охватить все разнообразие, необходима целенаправленная защита всех природных популяций Rhodiola.Species of the genus Rhodiola are popular medicinal plants, historically used as adaptogens and are a category particularly vulnerable due to intensive, irrational, under-controlled raw material procurement. To assess the viability and adaptive potential of a species under changing environmental conditions (aridization and warming of the climate), and to development of a conservation strategy requires knowledge of the genetic diversity of natural populations. Analysis of the nucleotide sequences of the atpB-rbcL and trnS-trnG intergenic spacers of chloroplast DNA in Rhodiola rosea, R. integrifolia, R. stephanii and R. pinnatifida showed that the populations of R. rosea, except Kamchatka, and R. pinnatifida were characterized by an average level of haplotype and nucleotide diversity. Kamchatka populations of R. rosea and R. integrifolia, and populations of R. stephanii were monomorphic that could be interpreted as a consequence of bottleneck in their evolutionary histories. In general, R. rosea is characterized by sufficiently high levels of genetic diversity and interpopulation differentiation and a weak gene flow. Phylogenetic analyzes showed that the Transbaikalian population, whose plants were identified as R. pinnatifida, is apparently R. rosea or its intraspecific taxon. For the conservation of genetic diversity it is purposefully necessary to protect all natural Rhodiola populations.
format Report
author Козыренко М.М.
Артюкова Е.В.
Позднякова Т.Э.
author_facet Козыренко М.М.
Артюкова Е.В.
Позднякова Т.Э.
author_sort Козыренко М.М.
title Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
title_short Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
title_full Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
title_fullStr Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
title_full_unstemmed Генетическое разнообразие видов Rhodiola (R. rosea, R. integrifolia, R. stephanii и R. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной ДНК
title_sort генетическое разнообразие видов rhodiola (r. rosea, r. integrifolia, r. stephanii и r. pinnatifida) по данным полиморфизма межгенных спейсеров хлоропластной днк
publisher Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета
publishDate 2018
url https://dx.doi.org/10.24411/2078-1318-2018-11047
https://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskoe-raznoobrazie-vidov-rhodiola-r-rosea-r-integrifolia-r-stephanii-i-r-pinnatifida-po-dannym-polimorfizma-mezhgennyh-speyserov/pdf
genre Kamchatka
genre_facet Kamchatka
op_doi https://doi.org/10.24411/2078-1318-2018-11047
_version_ 1766051471447556096