ИДЕНТИФИКАЦИЯ САНИТАРНО-ПОКАЗАТЕЛЬНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ ESCHERICHIA COLI И CLOSTRIDIUM PERFRINGENS НА ОСНОВЕ ПЦР-ТЕСТ-СИСТЕМ В СТРУКТУРЕ ЛЕЧЕБНОЙ ГРЯЗИ

• Main Authors: РОГАТЫХ С.В., КОФИАДИ И.А., МУРАДОВ С.В.
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Тульский государственный университет» 2016
• Subjects: ЛЕЧЕБНАЯ ГРЯЗЬ,THERAPEUTIC MUD,БАКТЕРИОСТАТИЧНОСТЬ,BACTERIA STATICS,ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ,POLYMERASE CHAIN REACTION,АНТИБАКТЕРИАЛЬНОСТЬ,ANTIBACTERIA; Kamchatka Peninsula; Kamchatka; КАМЧАТК*
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/identifikatsiya-sanitarno-pokazatelnyh-mikroorganizmov-escherichia-coli-i-clostridium-perfringens-na-osnove-ptsr-test-sistem-v; http://cyberleninka.ru/article_covers/17017614.png

Приводятся данные о разработке комплекса качественных тест-систем на основе полимеразной цепной реакции для установления качественного и количественного состава сообществ микроорганизмов. Целью исследования являлось создание ПЦР-тест-систем для детекции видоспецифичных фрагментов гена 16S рРНК санитарно-показательных микроорганизмов лечебной грязи месторождения озера Утиное (полуостров Камчатка). Проведена оценка эффективности нескольких методов очистки ДНК в отношении представителей санитарно-показательных микроорганизмов. Протестированы методики очистки ДНК, использующие различные комбинации химических (обработка GuSCN и CTAB) воздействий на клетки. Оценку эффективности проводили с помощью ПЦР в реальном времени. Приводятся данные о качественном соотношении санитарно-показательных микроорганизмов Escherichia coli и Clostridium perfringens в исходной пробе лечебной грязи и в пробе, подвергавшейся длительной экологической активации. В исходной лечебной грязи обнаружены бактерии E.coli и С. perfringens, в активированной лечебной грязи бактерии С. perfringens не обнаружены, бактерии E.coli в незначительном количестве. Эти данные подтверждаются ранее проведенными микробиологическими исследованиями проб на содержание бактерий E.coli и С. perfringens. Разработанная модификация метода позволяет на уровне ДНК устанавливать минимальную загрязненность грязе-лечебного месторождения санитарно-показательными микроорганизмами. This article presents the data on the development of a set of high-quality test systems based on the polymerase chain reaction to determine the qualitative and quantitative composition of microbial communities. The research purpose was to develop PCR-test systems for the detection of species-specific 16S rRNA gene fragments sanitary indicator microorganisms therapeutic mud deposits Lake Utinoye (Kamchatka peninsula). Assessment the effectiveness of several methods of DNA purification for the representatives of sanitary indicator microorganisms was carried out. The authors tested the methods of DNA purification using various combinations of chemical (processing GuSCN and CTAB) effects on cells. Evaluation of efficacy was performed by realtime PCR. The data on the ratio of quality sanitary indicator microorganisms Escherichia coli and Clostridium perfringens in the original sample curative mud and the sample was subjected to long-term environmental activation. In the initial therapeutic mud it was found E.coli and C. perfringens, in activated therapeutic mud C. perfringens, the E.coli in small quantities. These findings are supported by previous microbiological testing of samples for the content of E.coli and C. perfringens. Developed modification of the method allows to set a minimum level of DNA contaminated with fields of the therapeutic mud of sanitary indicators microorganisms.