ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА

Проведен анализ изменчивости трех локусов однонуклеотидного полиморфизма (ОНП), расположенных в митохондриальной ДНК (мтОНП), в популяциях азиатской нерки на обширной части ее ареала от Чукотки до Курильских островов. В 20 исследованных выборках нерки из 15 озерно-речных систем азиатского побережья...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА
Format: Text
Language:unknown
Published: Федеральное государственное унитарное предприятие «Тихоокеанский научно-исследовательский рыбохозяйственный центр» 2016
Subjects:
Online Access:http://cyberleninka.ru/article/n/filogeografiya-aziatskoy-nerki-oncorhynchus-nerka-po-dannym-izmenchivosti-mitohondrialnyh-lokusov-onp-analiz-stsenariev
http://cyberleninka.ru/article_covers/16907804.png
id ftcyberleninka:oai:cyberleninka.ru:article/16907804
record_format openpolar
spelling ftcyberleninka:oai:cyberleninka.ru:article/16907804 2023-05-15T15:54:54+02:00 ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА 2016 text/html http://cyberleninka.ru/article/n/filogeografiya-aziatskoy-nerki-oncorhynchus-nerka-po-dannym-izmenchivosti-mitohondrialnyh-lokusov-onp-analiz-stsenariev http://cyberleninka.ru/article_covers/16907804.png unknown Федеральное государственное унитарное предприятие «Тихоокеанский научно-исследовательский рыбохозяйственный центр» НЕРКА,ONCORHYNCHUS NERKA,МТДНК,ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ,ЦИТОХРОМ B,ЦИТОХРОМОКСИДАЗА,ФИЛОГЕОГРАФИЯ,ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ РАССЕЛЕНИЕ,SOCKEYE SALMON,MTDNA,SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM,SNP,CYTOCHROME B,CYTOCHROME OXIDASE,PHYLOGEOGRAPHY,POST-GLACIAL EXPANSION text 2016 ftcyberleninka 2016-11-08T00:36:40Z Проведен анализ изменчивости трех локусов однонуклеотидного полиморфизма (ОНП), расположенных в митохондриальной ДНК (мтОНП), в популяциях азиатской нерки на обширной части ее ареала от Чукотки до Курильских островов. В 20 исследованных выборках нерки из 15 озерно-речных систем азиатского побережья Тихого океана были выявлены два основных гаплотипа мтОНП GCC и GTT. В большинстве выборок оба гаплотипа присутствовали приблизительно в равном соотношении. В популяциях Курильских островов (кроме о. Шумшу) преобладал GTT-гаплотип, в выборке с Командорских островов обнаружен только GCC-гаплотип. Географическое распределение гап-лотипов, вероятно, объясняется историко-демографическими событиями, связанными с особенностями становления ареала азиатской нерки в среднем-позднем плейстоцене: его фрагментацией с последующим вторичным контактом между ранее дивергировавшими популяциями. Полученные нами данные позволяют рассматривать различные сценарии формирования современного разнообразия гаплотипов мтОНП нерки, подразумевающие неоднократное проникновение данного вида в Азию в периоды трансгрессии моря после плейстоценовых оледенений. Variability of three SNP loci allocated in the mitochondrial DNA ( One_CO1, One_Cytb_17, One_Cytb_26 ) is analyzed for sockeye salmon from its different habitats from Chukotka to Kuril Islands. Two basic haplotypes (GCC and GTT) are revealed in 20 samples of sockeye ( n = 33-100) from 15 lake-river systems. Their ratio is mostly equal, but GTT haplotype prevails in the populations from Kuril Islands (except Shumshu Island) and is absent in the sample from Commander Islands. This geographical pattern is presumably caused by historical-demographic events related to the species range formation in the middle-late Pleistocene: fragmentation of the areal and subsequent secondary contact between early diverged populations. Two scenarios are discussed, both with multiple expansions of the species to Asia during periods of oceanic transgression after Pleistocene glaciation. According to one of the scenarios, the GTT haplotype has more ancient origin somewhere on the mainland, whereas the GCC appeared much later in the central Kamchatka refugia. The second scenario presumes the origin of both haplotypes on Beringia Bridge where they diverged in the times of middle-Pleistocene (Wurm) glaciation. Text Chukotka Kamchatka Beringia CyberLeninka (Scientific Electronic Library) Sockeye ENVELOPE(-130.143,-130.143,54.160,54.160)
institution Open Polar
collection CyberLeninka (Scientific Electronic Library)
op_collection_id ftcyberleninka
language unknown
topic НЕРКА,ONCORHYNCHUS NERKA,МТДНК,ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ,ЦИТОХРОМ B,ЦИТОХРОМОКСИДАЗА,ФИЛОГЕОГРАФИЯ,ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ РАССЕЛЕНИЕ,SOCKEYE SALMON,MTDNA,SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM,SNP,CYTOCHROME B,CYTOCHROME OXIDASE,PHYLOGEOGRAPHY,POST-GLACIAL EXPANSION
spellingShingle НЕРКА,ONCORHYNCHUS NERKA,МТДНК,ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ,ЦИТОХРОМ B,ЦИТОХРОМОКСИДАЗА,ФИЛОГЕОГРАФИЯ,ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ РАССЕЛЕНИЕ,SOCKEYE SALMON,MTDNA,SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM,SNP,CYTOCHROME B,CYTOCHROME OXIDASE,PHYLOGEOGRAPHY,POST-GLACIAL EXPANSION
ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА
ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
topic_facet НЕРКА,ONCORHYNCHUS NERKA,МТДНК,ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ,ЦИТОХРОМ B,ЦИТОХРОМОКСИДАЗА,ФИЛОГЕОГРАФИЯ,ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ РАССЕЛЕНИЕ,SOCKEYE SALMON,MTDNA,SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM,SNP,CYTOCHROME B,CYTOCHROME OXIDASE,PHYLOGEOGRAPHY,POST-GLACIAL EXPANSION
description Проведен анализ изменчивости трех локусов однонуклеотидного полиморфизма (ОНП), расположенных в митохондриальной ДНК (мтОНП), в популяциях азиатской нерки на обширной части ее ареала от Чукотки до Курильских островов. В 20 исследованных выборках нерки из 15 озерно-речных систем азиатского побережья Тихого океана были выявлены два основных гаплотипа мтОНП GCC и GTT. В большинстве выборок оба гаплотипа присутствовали приблизительно в равном соотношении. В популяциях Курильских островов (кроме о. Шумшу) преобладал GTT-гаплотип, в выборке с Командорских островов обнаружен только GCC-гаплотип. Географическое распределение гап-лотипов, вероятно, объясняется историко-демографическими событиями, связанными с особенностями становления ареала азиатской нерки в среднем-позднем плейстоцене: его фрагментацией с последующим вторичным контактом между ранее дивергировавшими популяциями. Полученные нами данные позволяют рассматривать различные сценарии формирования современного разнообразия гаплотипов мтОНП нерки, подразумевающие неоднократное проникновение данного вида в Азию в периоды трансгрессии моря после плейстоценовых оледенений. Variability of three SNP loci allocated in the mitochondrial DNA ( One_CO1, One_Cytb_17, One_Cytb_26 ) is analyzed for sockeye salmon from its different habitats from Chukotka to Kuril Islands. Two basic haplotypes (GCC and GTT) are revealed in 20 samples of sockeye ( n = 33-100) from 15 lake-river systems. Their ratio is mostly equal, but GTT haplotype prevails in the populations from Kuril Islands (except Shumshu Island) and is absent in the sample from Commander Islands. This geographical pattern is presumably caused by historical-demographic events related to the species range formation in the middle-late Pleistocene: fragmentation of the areal and subsequent secondary contact between early diverged populations. Two scenarios are discussed, both with multiple expansions of the species to Asia during periods of oceanic transgression after Pleistocene glaciation. According to one of the scenarios, the GTT haplotype has more ancient origin somewhere on the mainland, whereas the GCC appeared much later in the central Kamchatka refugia. The second scenario presumes the origin of both haplotypes on Beringia Bridge where they diverged in the times of middle-Pleistocene (Wurm) glaciation.
format Text
author ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА
author_facet ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА
author_sort ХРУСТАЛЕВА АНАСТАСИЯ МИХАЙЛОВНА
title ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
title_short ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
title_full ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
title_fullStr ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
title_full_unstemmed ФИЛОГЕОГРАФИЯ АЗИАТСКОЙ НЕРКИ ОNCORHYNCHUS NERKA ПО ДАННЫМ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ЛОКУСОВ ОНП: АНАЛИЗ СЦЕНАРИЕВ ПОСЛЕЛЕДНИКОВОГО РАССЕЛЕНИЯ ВИДА НА АЗИАТСКОМ ПОБЕРЕЖЬЕ ТИХОГО ОКЕАНА
title_sort филогеография азиатской нерки оncorhynchus nerka по данным изменчивости митохондриальных локусов онп: анализ сценариев послеледникового расселения вида на азиатском побережье тихого океана
publisher Федеральное государственное унитарное предприятие «Тихоокеанский научно-исследовательский рыбохозяйственный центр»
publishDate 2016
url http://cyberleninka.ru/article/n/filogeografiya-aziatskoy-nerki-oncorhynchus-nerka-po-dannym-izmenchivosti-mitohondrialnyh-lokusov-onp-analiz-stsenariev
http://cyberleninka.ru/article_covers/16907804.png
long_lat ENVELOPE(-130.143,-130.143,54.160,54.160)
geographic Sockeye
geographic_facet Sockeye
genre Chukotka
Kamchatka
Beringia
genre_facet Chukotka
Kamchatka
Beringia
_version_ 1766390139043446784