Изменчивость регуляторных генов ВИЧ-1, выявляемых с помощью полимеразной цепной реакции

• Main Authors: Рыжов, Константин, Носик, М., Кравченко, А.
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: ОАО «Издательство «Медицина» 2015
• Subjects: ВИЧ; РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ ВИЧ; "ГНЕЗДОВАЯ" ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ; СТАДИЯ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ; Yakutia; Саха; Якути*; Якутия
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/izmenchivost-regulyatornyh-genov-vich-1-vyyavlyaemyh-s-pomoschyu-polimeraznoy-tsepnoy-reaktsii; http://cyberleninka.ru/article_covers/15806854.png

Исследовано 200 образцов от ВИЧ-инфицированных лиц: 50 образцов из Республики Саха (Якутия), 50 образцов из Вологодской области (Череповец) и 100 образцов из Московского региона ( Москва и Московская область). Все образцы были получены от больных, не проходивших антиретровирусную терапию. В ходе исследования обнаружено, что в результате одностадийной амплификации регуляторные гены vif, vpr, vpu, rev, tat и nef амплифицируются с малой чувствительностью. При проведении полимеразной цепной реакции (ПЦР) тех же образцов с использованием «гнездовой» ПЦР частота выявления этих генов значительно возросла. При изучении гена nef было установлено, что в поздних (3 и 4) стадиях инфекции в ядрах клеток наблюдается феномен сплайсинга, который отсутствует в ранних стадиях инфекции. Этот эффект может являться причиной перехода бессимптомной стадии ВИЧ-инфекции в манифестирующую. Впервые было показано, что изменчивость регуляторных генов зависит от субтипа вируса. In this work, a total of 200 samples from the HIV-infected individuals were analyzed: 50 samples from the Saha Republic (Yakutia), 50 samples from the Vologda Region (City of Cherepovets), and 100 samples from the Moscow Region (Moscow and Moscow Region). All samples were obtained from the patients who were not undergoing antiretroviral therapy. It was detected that the regulatory genes vif, vpr, vpu, rev, tat, and nef were amplified with moderate sensitivity after one-stage amplification. When those samples were analyzed by the nested PCR the detection ratio was much higher. While studying nef-gene the phenomena of the splicing in cells cores was detected at the advanced stages of the HIV-infection (3 and 4 stages). At the same time, the splicing was not detected at the earlier stages of the HIV-infection. This effect might be the cause of the transition from asymptomatic stage of the infection to the advanced stage. It was also shown for the first time that the variability of the regulatory genes correlated with the virus subtype.