ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВАРИАНТЫ ВИЧ-1 В АЗИАТСКОЙ ЧАСТИ РОССИИ (2005-2010)

• Main Authors: Казеннова, Елена, Васильев, А., Лаповок, И., Гоишечкин, А., Лага, В., Саламов, Г., Туманов, А., Парыгина, О., Рузаева, Л., Грезина, Л., Серкина, Т., Кауфман, О., Ооржак, Н., Лукашов, В., Бобкова, М.
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: ОАО «Издательство «Медицина» 2013
• Subjects: ВИЧ-ИНФЕКЦИЯ; МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МОНИТОРИНГ; АЗИАТСКАЯ ЧАСТЬ РОССИИ; Magadan; Yakutsk; Ненец*; Якути*
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskie-varianty-vich-1-v-aziatskoy-chasti-rossii-2005-2010; http://cyberleninka.ru/article_covers/15806747.png

Статья посвящена исследованию генетических вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в азиатской части Российской Федерации в 2005-2010 гг. Исследовано 427 образцов ВИЧ-1, собранных от ВИЧ-инфицированных пациентов в Хабаровске, Магадане, Кургане, Красноярске, Ноябрьске (Ямало-Ненецкий округ), Якутии, Алтайском крае и Тыве. В качестве основных методов субтипирования прибегали к секвенированию нескольких областей генома ВИЧ-1 с последующим филогенетическим анализом или применением специализированных Интернет-ресурсов. Во всех обследованных в 2005-2010 гг. регионах продолжал доминировать вирус, принадлежащий к генетическому варианту подтипа А iDU-A, характерному для эпидемии ВИЧ-инфекции в России. Этот вариант преобладал в группах потребителей инъекционных наркотиков и лиц, инфицированных гетеросексуальным путем. Наряду с iDU-A в обследованных регионах встречаются и другие варианты ВИЧ-1, в первую очередь подтип B и рекомбинант CRF03_AB. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 в целом остается невысоким. Отмечен рост генетической изменчивости среди индивидуальных случаев заражения iDU-A на территории азиатской части Российской Федерации в 2005-2010 гг. (2,6-6,8%) по сравнению с вариантами, распространенными на европейской части страны в 1996-1999 гг. (1%). The HiV-1 genetic variants circulated in the Asian part of the Russian Federation in 2005-2010 were studied. The samples of HiV-1 (427 in total) were collected in Khabarovsk, Magadan, Kurgan, Krasnoyarsk, Noyabr’sk, Yakutsk, Altay, and Tyva. Sequencing of some genome regions followed by the phylogenetic analysis or specific internet resource sampling were used as the main methods of the HiV subtyping. The domination of the iDU-A HiV-1 genetic variant typical of HiV-infection epidemic in Russia was shown in all regions tested in 2005-2010. This variant prevailed both in iDUs and heterosexuals. in addition to iDU-A, some other HiV-1 genetic variants were found among them: subtype B and recombinant CRF03_AB. The HiV-1 genetic polymorphism in Russia was found to be low. An increase in the genetic distance among studied de novo samples was noted in the Asian part of Russia in 2005-2010 (26-68%) as compared to the European variants in 1996-1999 (10%).