ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН
ГОРБУША, МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ ДНК, МЕЖПОПУЛЯЦИОННАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ Проанализирована изменчивость нуклеотидной последовательности фрагмента Cytb/D-loop мтДНК в выборках горбуши Камчатки и о. Сахалин. Анализ изменчивости длины рестриктных фрагментов мтДНК позволил выявить 23 комбинированных гаплотипа. На ос...
Main Authors: | , , |
---|---|
Format: | Text |
Language: | unknown |
Published: |
Федеральное государственное унитарное предприятие «Камчатский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии»
2009
|
Subjects: | |
Online Access: | http://cyberleninka.ru/article/n/polimorfizm-mtdnk-gorbushi-kamchatki-i-ostrova-sahalin http://cyberleninka.ru/article_covers/15163157.png |
id |
ftcyberleninka:oai:cyberleninka.ru:article/15163157 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftcyberleninka:oai:cyberleninka.ru:article/15163157 2023-05-15T16:59:10+02:00 ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН Шпигальская, Н. Брыков, Вл Кухлевский, А. 2009 text/html http://cyberleninka.ru/article/n/polimorfizm-mtdnk-gorbushi-kamchatki-i-ostrova-sahalin http://cyberleninka.ru/article_covers/15163157.png unknown Федеральное государственное унитарное предприятие «Камчатский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии» text 2009 ftcyberleninka 2015-12-08T02:05:36Z ГОРБУША, МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ ДНК, МЕЖПОПУЛЯЦИОННАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ Проанализирована изменчивость нуклеотидной последовательности фрагмента Cytb/D-loop мтДНК в выборках горбуши Камчатки и о. Сахалин. Анализ изменчивости длины рестриктных фрагментов мтДНК позволил выявить 23 комбинированных гаплотипа. На основании полученных оценок гаплотипического и нуклеотидного разнообразия, было отмечено, что для горбуши о. Сахалин эти показатели, в целом, выше, чем для большей части камчатских популяций. В результате применения методов F-статистики для оценки уровня генетической подразделённости исследуемых популяций, были показаны статистически значимые различия между большинством сравниваемых пар выборок. В структуре UPGMAи NJ-дендрограмм, построенных на основе генетических расстояний по Нею, не обнаружено четкой дифференциации между популяциями Западной и Восточной Камчатки, в то же время популяции о. Сахалин занимают относительно обособленное положение. При анализе групп выборок, объединенных в соответствии с географическим положением, величина внутрипопуляционной изменчивости составила 93,15%, доля, приходящаяся на межгрупповую компоненту, составила 3,81 % и заметно превысила долю межпопуляционной дисперсии внутри групп 3,04%. Полученные результаты свидетельствуют о генетической гетерогенности горбуши на изучаемой части ареала, а уровень межрегиональной изменчивости более значителен, чем межпопуляционной. PINK SALMON, MITOCHONDRIAL DNA, INTERPOPULATION VARIATION Nucleotide sequence variation in the part of Cytb/D-loop mtDNA have been analyzed in pink salmon samples from Kamchatka and Sakhalin. Analysis of the variation of mtDN restrict fragments length revealed 23 compocite haplotypes. It was noted, basing on the haplotype and nucleotide diversity data, that Sakhalin pink salmon had generally higher indexes, than majority of Kamchatkan populations had. Significant statistical differences were demonstrated in majority ofpairs (pairs of samples) compared, when using the F-statistics method for estimation of the structural genetic level in studied populations. There were no clear differences revealed between populations of West and East Kamchatka in the structure of UPGMAand NJ-joint-trees, built on the base of Nei's genetic distances; the Sakhalin populations demonstrated relatively isolated position. In the analysis of groups of samples, united according to the geographical position, the intrapopulation variation were 93,15%, the intergroup component was 3,81%, and it was visibly higher, than the interpopulation dispersion in the groups (3,04%). The results we have obtained can indicate of pink salmon genetic heterogeneity in the tudied part of the areal, and of the higher level of inter-regional variation, comparing it to the interpopulation level. Text Kamchatka Pink salmon Sakhalin КАМЧАТК* CyberLeninka (Scientific Electronic Library) |
institution |
Open Polar |
collection |
CyberLeninka (Scientific Electronic Library) |
op_collection_id |
ftcyberleninka |
language |
unknown |
description |
ГОРБУША, МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ ДНК, МЕЖПОПУЛЯЦИОННАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ Проанализирована изменчивость нуклеотидной последовательности фрагмента Cytb/D-loop мтДНК в выборках горбуши Камчатки и о. Сахалин. Анализ изменчивости длины рестриктных фрагментов мтДНК позволил выявить 23 комбинированных гаплотипа. На основании полученных оценок гаплотипического и нуклеотидного разнообразия, было отмечено, что для горбуши о. Сахалин эти показатели, в целом, выше, чем для большей части камчатских популяций. В результате применения методов F-статистики для оценки уровня генетической подразделённости исследуемых популяций, были показаны статистически значимые различия между большинством сравниваемых пар выборок. В структуре UPGMAи NJ-дендрограмм, построенных на основе генетических расстояний по Нею, не обнаружено четкой дифференциации между популяциями Западной и Восточной Камчатки, в то же время популяции о. Сахалин занимают относительно обособленное положение. При анализе групп выборок, объединенных в соответствии с географическим положением, величина внутрипопуляционной изменчивости составила 93,15%, доля, приходящаяся на межгрупповую компоненту, составила 3,81 % и заметно превысила долю межпопуляционной дисперсии внутри групп 3,04%. Полученные результаты свидетельствуют о генетической гетерогенности горбуши на изучаемой части ареала, а уровень межрегиональной изменчивости более значителен, чем межпопуляционной. PINK SALMON, MITOCHONDRIAL DNA, INTERPOPULATION VARIATION Nucleotide sequence variation in the part of Cytb/D-loop mtDNA have been analyzed in pink salmon samples from Kamchatka and Sakhalin. Analysis of the variation of mtDN restrict fragments length revealed 23 compocite haplotypes. It was noted, basing on the haplotype and nucleotide diversity data, that Sakhalin pink salmon had generally higher indexes, than majority of Kamchatkan populations had. Significant statistical differences were demonstrated in majority ofpairs (pairs of samples) compared, when using the F-statistics method for estimation of the structural genetic level in studied populations. There were no clear differences revealed between populations of West and East Kamchatka in the structure of UPGMAand NJ-joint-trees, built on the base of Nei's genetic distances; the Sakhalin populations demonstrated relatively isolated position. In the analysis of groups of samples, united according to the geographical position, the intrapopulation variation were 93,15%, the intergroup component was 3,81%, and it was visibly higher, than the interpopulation dispersion in the groups (3,04%). The results we have obtained can indicate of pink salmon genetic heterogeneity in the tudied part of the areal, and of the higher level of inter-regional variation, comparing it to the interpopulation level. |
format |
Text |
author |
Шпигальская, Н. Брыков, Вл Кухлевский, А. |
spellingShingle |
Шпигальская, Н. Брыков, Вл Кухлевский, А. ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
author_facet |
Шпигальская, Н. Брыков, Вл Кухлевский, А. |
author_sort |
Шпигальская, Н. |
title |
ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
title_short |
ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
title_full |
ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
title_fullStr |
ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
title_full_unstemmed |
ПОЛИМОРФИЗМ МТДНК ГОРБУШИ КАМЧАТКИ И ОСТРОВА САХАЛИН |
title_sort |
полиморфизм мтднк горбуши камчатки и острова сахалин |
publisher |
Федеральное государственное унитарное предприятие «Камчатский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии» |
publishDate |
2009 |
url |
http://cyberleninka.ru/article/n/polimorfizm-mtdnk-gorbushi-kamchatki-i-ostrova-sahalin http://cyberleninka.ru/article_covers/15163157.png |
genre |
Kamchatka Pink salmon Sakhalin КАМЧАТК* |
genre_facet |
Kamchatka Pink salmon Sakhalin КАМЧАТК* |
_version_ |
1766051366168428544 |