Изменчивость последовательности ITS1-ген 5. 8s рРНК-ITS2 в ходе дивергенции видов рода манник (Glyceria R. br. )

• Main Authors: Родионов, Александр, Коцинян, Армен, Гнутиков, Александр, Доброрадова, Марина, Мачс, Эдуард
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: Общество с ограниченной ответственностью «Эко-Вектор» 2011
• Subjects: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ФИЛОГЕНИЯ; ДИВЕРГЕНЦИЯ ГЕНОМОВ; МЕЖВИДОВЫЕ ГИБРИДЫ; Pleuropogon sabinii
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/izmenchivost-posledovatelnosti-its1-gen-5-8s-rrnk-its2-v-hode-divergentsii-vidov-roda-mannik-glyceria-r-br; http://cyberleninka.ru/article_covers/14974881.png

Секвенирование и сравнительный анализ района ITS1-ген 5.8S рРНК -ITS2 ядерного генома 13 видов рода Glyceria, 4 видов рода Melica и 1 вида монотипного рода Pleuropogon показало, что виды рода Glyceria имеют три гаплотипа: 1) Гаплотипы группы А найдены только у видов подрода Glyceria секции Glyceria (G. septentrionalis, G. fluitans, G. declinata, G. occidentalis, G. notata, G. borealis, G. leptostachya) и у вида Pleuropogon sabinii; 2) Гаплотипы группы С характерны для видов подрода Hydropoa секции Hydropoa (G. grandis, G. х amurensis, G. triflora, G. maxima) и G. leptolepis, относимая к sect. Lithuanicae; 3) Гаплотипы группы В для видов подрода Hydropoa секций Striatae (G. elata, G. striata, G. neogaea, G. canadensis), Scolochloiformes (G. alnasteretum, G. spiculosa) и G. lithuanica из sect. Lithuanicae. Виды с гаплотипами группы В при разных моделях построения филогенетического древа располагаются в основании древа рода и группируются в кладу всегда с низкими бутстрэпиндексами. Судя по нуклеотидным последовательностям ITS и гена 5.8S рРНК, виды секций Hydropoa и Glyceria представляют собой две независимо возникшие монофилетичные ветви в эволюции рода Glyceria, к последней из которых относится и Pleuropogon sabinii. Comparative analysis of the sequence ITS1-5.8S rRNA gene-ITS2 of the nuclear genome of 13 species of genus Glyceria, 4 species of Melica and a species of monotypic genus Pleuropogon showed that the species of the genus Glyceria have 3 haplotypes: 1) Haplotype A was found only in species of the subgenus Glyceria section Glyceria (G. septentrionalis, G. fluitans, G. declinata, G. occidentalis, G. notata, G. borealis, G. leptostachya) and in Pleuropogon sabinii; 2) Haplotype C is characteristic of the subgenus Hydropoa, section Hydropoa (G. grandis, G. х amurensis, G. triflora, G. maxima) and sect. Lithuanicae (G. leptolepis); 3) Haplotype B is found in the species of the subgenus Hydropoa sections Striatae (G. elata, G. striata, G. neogaea, G. canadensis), Scolochloiformes (G. alnasteretum, G. spiculosa) and G. lithuanica of sect. Lithuanicae. Species carring haplotype B are located at the base of the phylogenetic tree of the genus Glyceria and/or clustered with low bootstrap indices. On the phylogenetic trees inferred by the analysis of the sequences ITS and 5.8S rDNA both sect. Glyceria and sect. Hydropoa represented two sister monophyly branches. The species Pleuropogon sabinii belong to the branch of subgenus Glyceria as a sister monotypic branch to the branch of the sect. Glyceria.