ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ И ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ДЛИННОХВОСТОГО СУСЛИКА (SPERMOPHILUS UNDULATUS) ПО ДАННЫМ RAPD-PCR-АНАЛИЗА

• Main Authors: Цвирка, Марина, Кораблёв, Владимир
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Национальный исследовательский Томский государственный университет" 2012
• Subjects: RAPD-PCR-АНАЛИЗ; RAPD-МАРКЕРЫ; ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ; ВНУТРИВИДОВАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ; ФИЛОГЕНИЯ; Obo; Yakutia; Siberia
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskaya-izmenchivost-i-differentsiatsiya-dlinnohvostogo-suslika-spermophilus-undulatus-po-dannym-rapd-pcr-analiza; http://cyberleninka.ru/article_covers/14504641.png

Методом RAPD-PCR-анализа суммарной клеточной ДНК с использованием десяти произвольных олигонуклеотидных праймеров впервые проведено сравнение генетической изменчивости и выяснен уровень генетической дифференциации четырех подвидов длиннохвостого суслика Spermophilus undulatus (Pallas 1773), которые по аллозимным данным относятся к двум разобщенным географическим формам западной (S. u. eversmanni) и восточной (S. u. intercedens, S. u. menzbieri, S. u. jacutensis). Идентифицированы 288 признаков, включая таксон-специфичные маркерные фрагменты для отдельных подвидов, а также для двух географических форм. Рассчитаны значения параметров генетического разнообразия и построены NJ-филогенетическая реконструкция и UPGMA-дендрограмма генетического сходства популяций. Показаны высокий уровень генетической дифференциации западной и восточной форм длиннохвостого суслика (D = 0,24-0,27; р = 0,00) и близость восточных подвидов между собой (D = 0,005-0,008; р = 1,00). Проведена таксономическая оценка их молекулярных различий. The manuscript ofTsvirku M.V. and Korablev V.P. «Genetic variability and differentiation of long-tailed ground squirrel (Spermophilus undulatus) based on RAPD-PCR analysis» devoted to clarify the intraspecific taxonomy using the methods of molecular genetics. The study contributes to the processes of microevolution and speciation in Mammals, and studies of biodiversity in Siberia and Russian Far East. Long-tailed ground squirrel Spermophilus undulatus (Pallas 1778) is the polytypic species of Holarctic genus Spermophilus (F. Cuvier 1825). It is distribute in the mountainous and foothill regions of the North-East Asia (from the Tien Shan to the Amur region and Yakutia). Wide geographical spread caused the considerable variability ofphenotypic characteristics of its component forms. Six subspecies of modern long-tailed ground squirrel: S. undulatus undulatus (Pallas 1778); S. u. stramineus (Obo-lensky 1927); S. u. eversmanni (Brandt 1841); S. u. intercedens (Ognev 1937); S. u. jacutensis (Brandt 1843); S. u. menzbieri (Ognev 1937) (Gromov et al, 1963; Gromov et al, 1965; Gromov, Erbaeva, 1995) were described on the basis of bio-ecological and morphologicalfeatures. Despite of this fact the intraspecific systematics of S. undulatus based on classical morphological data is controversial and requires confirmation with using modern molecular genetic techniques. To clarify the intraspecific taxonomy of S. undulatus comparison of genetic polymorphism of four subspecies (S. u. intercedens, S. u. eversmanni, S. u. menzbieri and S. u. jacutensis) by RAPD-PCR analysis of total cellular DNA using ten arbitrary oligonucleotide primers. For the first time identified features showing significant differences between "western " and "eastern " forms, as well as taxon-specific marker fragments for individual subspecies. The values of the parameters of genetic diversity and phylo-genetic NJ-tree and UPGMA-dendrogram of genetic similarity ofpopulations were obtained. High level of genetic differentiation between the "western" and "eastern"forms of long-tailed ground squirrel (D = 0.24—0.27, p = 0.00) and the proximity of the eastern subspecies of each to other (D = 0.005—0.008, p = 1.00) were showed. The obtained results allow to consider the validity of an equal share of two long-tailed ground squirrel geographical forms, either as separate taxa within the species level nadvida S. undulatis, or within a single species, which has a maximum intraspecific geographical variability.