Tipificación molecular y actividad antimicrobiana de levaduras antarticas

La identificación molecular de hongos se basa principalmente en la comparación a nivel de secuencia nucleotídica de regiones del DNA ribosómico. Entre, las regiones más utilizadas están los espaciadores transcritos internos 1 y 2 (ITS1 e ITS2) incluyendo la región conservada 5.8S y los dominios D1/D...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Carrasco-Troncoso, Mario Esteban
Other Authors: Baeza-Cancino, Marcelo, Universidad de Chile
Format: Master Thesis
Language:Spanish
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10533/181485
Description
Summary:La identificación molecular de hongos se basa principalmente en la comparación a nivel de secuencia nucleotídica de regiones del DNA ribosómico. Entre, las regiones más utilizadas están los espaciadores transcritos internos 1 y 2 (ITS1 e ITS2) incluyendo la región conservada 5.8S y los dominios D1/D2 del rDNA 26S. Estos marcadores han mostrado buenos resultados en identificación de levaduras, no obstante en muchos casos, estos marcadores no han mostrado suficiente nivel de resolución para la identificación de levaduras a nivel de especie. Debido a esto, constantemente se está en la búsqueda de marcadores moleculares con mayor nivel de resolución taxonómico. Un candidato es el gen mitocondrial citocromo oxidasa 1 (COI), postulado como marcador universal en organismos eucariontes, el cuál ha sido muy poco utilizado en hongos. Además, el fenotipo micocida (anteriormente Killer), corresponde a la capacidad de matar a otras levaduras por medio de la producción de toxinas proteicas. En algunos casos este fenotipo es codificado por virus del tipo RNA de doble hebra (dsRNA). Este tipo de virus se encuentra en una amplia variedad de levaduras y hongos filamentosos, no posee ciclo extracelular, coevolucionando con su hospedero y no siempre está asociado a algún fenotipo “killer”. Tanto la actividad micocida como la presencia dsRNAs, han sido postulados como herramientas adicionales en tipificación de levaduras.