发病鲆鲽类分离菌株的16S rRNA基因测序分析

细菌性疾病是中国海水养殖鲆鲽类的主要病害,为全面了解病原菌种类,本研究对1999~2012年从山东、江苏、河北、天津等沿海地区养殖场发病鲆鲽鱼类中分离得到的124株优势菌株进行了16S rRNA基因测序和系统发育学分析。将基因序列与GenBank核酸序列数据库进行相似度比对分析,结果显示,有83株与弧菌属(Vibriosp.)细菌相似度最高,11株与气单胞菌属(Aeromonas sp.)细菌相似度最高,4株与爱德华氏菌属(Edwardsiella sp.)细菌相似度最高,26株为其他15种属的细菌。根据系统发育学分析结果,进一步将66株菌鉴定为16个种,优势种为溶藻弧菌(V.alginoly...

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Bibliographic Details
Main Authors: 兰欣, 李杰, 李贵阳, 肖鹏, 莫照兰
Format: Report
Language:Chinese
Published: 2020
Subjects:
16S
Online Access:http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/175245
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spelling ftchinacasciocas:oai:ir.qdio.ac.cn:337002/175245 2023-05-15T18:15:54+02:00 发病鲆鲽类分离菌株的16S rRNA基因测序分析 Sequencing and Phylogenetic Analysis of the 16S rRNA Genes of Bacterial Strains Isolated from Diseased Flatfish 兰欣 李杰 李贵阳 肖鹏 莫照兰 2020-01-01 http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/175245 中文 chi 渔业科学进展 http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/175245 鲆鲽类 病原菌 16S rRNA基因 系统发育学分析 鉴定 期刊论文 2020 ftchinacasciocas 2022-06-27T05:45:57Z 细菌性疾病是中国海水养殖鲆鲽类的主要病害,为全面了解病原菌种类,本研究对1999~2012年从山东、江苏、河北、天津等沿海地区养殖场发病鲆鲽鱼类中分离得到的124株优势菌株进行了16S rRNA基因测序和系统发育学分析。将基因序列与GenBank核酸序列数据库进行相似度比对分析,结果显示,有83株与弧菌属(Vibriosp.)细菌相似度最高,11株与气单胞菌属(Aeromonas sp.)细菌相似度最高,4株与爱德华氏菌属(Edwardsiella sp.)细菌相似度最高,26株为其他15种属的细菌。根据系统发育学分析结果,进一步将66株菌鉴定为16个种,优势种为溶藻弧菌(V.alginolyticus)、哈氏弧菌(V.harveyi)、鳗弧菌(V.anguillarum)、杀鲑气单胞菌(A.salmonicida)和迟缓爱德华氏菌(E.tarda)。选择其中的9株鳗弧菌和4株迟缓爱德华氏菌进行人工感染实验,结果显示,其中7株鳗弧菌和3株迟缓爱德华氏菌对大菱鲆(Scophthalmus maximus)有较强的致病性。研究结果可为阐明中国海水养殖鲆鲽类的流行病发生历史、病原种类、病原监测及疾病控制提供重要参考。 Report Scophthalmus maximus Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences: IOCAS-IR
institution Open Polar
collection Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences: IOCAS-IR
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language Chinese
topic 鲆鲽类
病原菌
16S
rRNA基因
系统发育学分析
鉴定
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