长牡蛎nacrein基因的克隆、结构及进化分析

首次在长牡蛎(Crassostrea gigas)中克隆得到一种新的贝壳基质蛋白nacrein-like protein F3的全长cDNA序列。nacrein-like protein F3基因cDNA全长1499bp, 其中编码区长度为1242bp, 编码一条含413个氨基酸残基的多肽链。氨基酸序列比对和结构域分析均表明其为合浦珠母贝(Pinctada fucata) nacrein的同源蛋白,含有1个保守的α-碳酸酐酶结构域,但由于重复结构域的插入,α-碳酸酐酶结构域被间隔成2个亚结构域。系统进化分析显示nacrein-like proteinF3与贻贝(Mytilus californ...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: 宋小瑞, 王晓通, 李莉, 张国范
Format: Report
Language:Chinese
Published: 2015
Subjects:
长牡蛎(Crassostrea gigas)
碳酸酐酶结构域
系统进化分析
Pacific
Crassostrea gigas
Pacific oyster
Online Access:http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/172040
Description
Summary:首次在长牡蛎(Crassostrea gigas)中克隆得到一种新的贝壳基质蛋白nacrein-like protein F3的全长cDNA序列。nacrein-like protein F3基因cDNA全长1499bp, 其中编码区长度为1242bp, 编码一条含413个氨基酸残基的多肽链。氨基酸序列比对和结构域分析均表明其为合浦珠母贝(Pinctada fucata) nacrein的同源蛋白,含有1个保守的α-碳酸酐酶结构域,但由于重复结构域的插入,α-碳酸酐酶结构域被间隔成2个亚结构域。系统进化分析显示nacrein-like proteinF3与贻贝(Mytilus californianus)nacrein-like protein进化关系最近。此外,在软体动物中,双壳纲nacrein-like proteins进化速度相对较快,推测与寒武纪时期剧烈的环境变化有关,如影响贝壳形成的海水化学变化。

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