Is the Species Flock Concept Operational? The Antarctic Shelf Case

International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antar...

Full description

Bibliographic Details
Published in:PLoS ONE
Main Authors: Lecointre, Guillaume, Améziane, Nadia, Boisselier, Marie-Catherine, Bonillo, Céline, BUSSON, Frederic, Causse, Romain, Chenuil, Anne, Couloux, Arnaud, Coutanceau, Jean-Pierre, Cruaud, Corinne, d'Acoz, Cédric d'Udekem, De Ridder, Chantal, Denys, Gaël, Dettaï, Agnès, Duhamel, Guy, Eléaume, Marc, Feral, Jean-Pierre, Gallut, Cyril, Havermans, Charlotte, Held, Christoph, Hemery, Lenaïg, Lautrédou, Anne-Claire, Martin, Patrick, Ozouf-Costaz, Catherine, Pierrat, Benjamin, Pruvost, P., Puillandre, Nicolas, Samadi, Sarah, Saucède, Thomas, Schubart, Christoph, DAVID, Bruno
Other Authors: Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Systématique, adaptation, évolution (SAE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Taxonomie - Collections (TC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hautes Etudes d’Ingénieur Lille (HEI), Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Station Marine d'Endoume, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Adaptation, Intégration, Réticulation et Evolution (AIRE), Evolution Paris Seine, Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS), Université libre de Bruxelles (ULB), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Département Milieux et Peuplements Aquatiques, Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI), Laboratoire de Conception Fabrication Commande (LCFC), Université de Lorraine (UL)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM), Biogéosciences UMR 6282 Dijon (BGS), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ichtyologie générale et appliquée, Universität Regensburg (UR)
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: HAL CCSD 2013
Subjects:
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De Ridder, Chantal
Denys, Gaël
Dettaï, Agnès
Duhamel, Guy
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Feral, Jean-Pierre
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Hemery, Lenaïg
Lautrédou, Anne-Claire
Martin, Patrick
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Is the Species Flock Concept Operational? The Antarctic Shelf Case
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Phylogenetics and taxonomy
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description International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antarctic shelf: teleost fishes, crinoids (feather stars), echinoids (sea urchins) and crustacean arthropods. Practical limitations led us to prioritize the three historical criteria (endemicity, monophyly, species richness) over the two ecological ones (ecological diversity and habitat dominance). We propose a new protocol which includes an iterative fine-tuning of the monophyly and endemicity criteria in order to discover unsuspected flocks. As a result nine « full » species flocks (fulfilling the five criteria) are briefly described. Eight other flocks fit the three historical criteria but need to be further investigated from the ecological point of view (here called « core flocks »). The approach also shows that some candidate taxonomic components are no species flocks at all. The present study contradicts the paradigm that marine species flocks are rare. The hypothesis according to which the Antarctic shelf acts as a species flocks generator is supported, and the approach indicates paths for further ecological studies and may serve as a starting point to investigate the processes leading to flock-like patterning of biodiversity.
author2 Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)
Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)
Systématique, adaptation, évolution (SAE)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Taxonomie - Collections (TC)
Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Hautes Etudes d’Ingénieur Lille (HEI)
Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU)
Station Marine d'Endoume
Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2
Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE)
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Adaptation, Intégration, Réticulation et Evolution (AIRE)
Evolution Paris Seine
Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS)
Université libre de Bruxelles (ULB)
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Département Milieux et Peuplements Aquatiques
Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2
Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI)
Laboratoire de Conception Fabrication Commande (LCFC)
Université de Lorraine (UL)-Arts et Métiers Sciences et Technologies
HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)
Biogéosciences UMR 6282 Dijon (BGS)
Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire d'Ichtyologie générale et appliquée
Universität Regensburg (UR)
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author Lecointre, Guillaume
Améziane, Nadia
Boisselier, Marie-Catherine
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BUSSON, Frederic
Causse, Romain
Chenuil, Anne
Couloux, Arnaud
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Duhamel, Guy
Eléaume, Marc
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Gallut, Cyril
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Hemery, Lenaïg
Lautrédou, Anne-Claire
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Puillandre, Nicolas Samadi, Sarah Saucède, Thomas Schubart, Christoph DAVID, Bruno Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Systématique, adaptation, évolution (SAE) Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Taxonomie - Collections (TC) Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Hautes Etudes d’Ingénieur Lille (HEI) Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU) Station Marine d'Endoume Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE) Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) Adaptation, Intégration, Réticulation et Evolution (AIRE) Evolution Paris Seine Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS) Université libre de Bruxelles (ULB) Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN) Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU) Département Milieux et Peuplements Aquatiques Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI) Laboratoire de Conception Fabrication Commande (LCFC) Université de Lorraine (UL)-Arts et Métiers Sciences et Technologies HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM) Biogéosciences UMR 6282 Dijon (BGS) Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Laboratoire d'Ichtyologie générale et appliquée Universität Regensburg (UR) 2013 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/document https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/file/pone.0068787.pdf https://doi.org/10.1371/journal.pone.0068787 en eng HAL CCSD Public Library of Science info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0068787 mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/document https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/file/pone.0068787.pdf doi:10.1371/journal.pone.0068787 http://creativecommons.org/licenses/by/ info:eu-repo/semantics/OpenAccess ISSN: 1932-6203 EISSN: 1932-6203 PLoS ONE https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (8), pp.e68787. ⟨10.1371/journal.pone.0068787⟩ [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] info:eu-repo/semantics/article Journal articles 2013 ftccsdartic https://doi.org/10.1371/journal.pone.0068787 2021-12-19T00:05:26Z International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antarctic shelf: teleost fishes, crinoids (feather stars), echinoids (sea urchins) and crustacean arthropods. Practical limitations led us to prioritize the three historical criteria (endemicity, monophyly, species richness) over the two ecological ones (ecological diversity and habitat dominance). We propose a new protocol which includes an iterative fine-tuning of the monophyly and endemicity criteria in order to discover unsuspected flocks. As a result nine « full » species flocks (fulfilling the five criteria) are briefly described. Eight other flocks fit the three historical criteria but need to be further investigated from the ecological point of view (here called « core flocks »). The approach also shows that some candidate taxonomic components are no species flocks at all. The present study contradicts the paradigm that marine species flocks are rare. The hypothesis according to which the Antarctic shelf acts as a species flocks generator is supported, and the approach indicates paths for further ecological studies and may serve as a starting point to investigate the processes leading to flock-like patterning of biodiversity. Article in Journal/Newspaper Antarc* Antarctic Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe) Antarctic Eastman ENVELOPE(-62.985,-62.985,-65.166,-65.166) The Antarctic PLoS ONE 8 8 e68787