Is the Species Flock Concept Operational? The Antarctic Shelf Case
International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antar...
Published in: | PLoS ONE |
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Main Authors: | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
Other Authors: | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
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Language: | English |
Published: |
HAL CCSD
2013
|
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[SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] |
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[SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] Lecointre, Guillaume Améziane, Nadia Boisselier, Marie-Catherine Bonillo, Céline, BUSSON, Frederic Causse, Romain Chenuil, Anne Couloux, Arnaud Coutanceau, Jean-Pierre Cruaud, Corinne d'Acoz, Cédric d'Udekem De Ridder, Chantal Denys, Gaël Dettaï, Agnès Duhamel, Guy Eléaume, Marc Feral, Jean-Pierre Gallut, Cyril Havermans, Charlotte Held, Christoph Hemery, Lenaïg Lautrédou, Anne-Claire Martin, Patrick Ozouf-Costaz, Catherine Pierrat, Benjamin Pruvost, P. Puillandre, Nicolas Samadi, Sarah Saucède, Thomas Schubart, Christoph DAVID, Bruno Is the Species Flock Concept Operational? The Antarctic Shelf Case |
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[SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] |
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International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antarctic shelf: teleost fishes, crinoids (feather stars), echinoids (sea urchins) and crustacean arthropods. Practical limitations led us to prioritize the three historical criteria (endemicity, monophyly, species richness) over the two ecological ones (ecological diversity and habitat dominance). We propose a new protocol which includes an iterative fine-tuning of the monophyly and endemicity criteria in order to discover unsuspected flocks. As a result nine « full » species flocks (fulfilling the five criteria) are briefly described. Eight other flocks fit the three historical criteria but need to be further investigated from the ecological point of view (here called « core flocks »). The approach also shows that some candidate taxonomic components are no species flocks at all. The present study contradicts the paradigm that marine species flocks are rare. The hypothesis according to which the Antarctic shelf acts as a species flocks generator is supported, and the approach indicates paths for further ecological studies and may serve as a starting point to investigate the processes leading to flock-like patterning of biodiversity. |
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Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Systématique, adaptation, évolution (SAE) Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Taxonomie - Collections (TC) Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Hautes Etudes d’Ingénieur Lille (HEI) Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU) Station Marine d'Endoume Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE) Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) Adaptation, Intégration, Réticulation et Evolution (AIRE) Evolution Paris Seine Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS) Université libre de Bruxelles (ULB) Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN) Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU) Département Milieux et Peuplements Aquatiques Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI) Laboratoire de Conception Fabrication Commande (LCFC) Université de Lorraine (UL)-Arts et Métiers Sciences et Technologies HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM) Biogéosciences UMR 6282 Dijon (BGS) Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Laboratoire d'Ichtyologie générale et appliquée Universität Regensburg (UR) |
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Puillandre, Nicolas Samadi, Sarah Saucède, Thomas Schubart, Christoph DAVID, Bruno Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) Systématique, adaptation, évolution (SAE) Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Taxonomie - Collections (TC) Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Hautes Etudes d’Ingénieur Lille (HEI) Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU) Station Marine d'Endoume Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE) Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) Adaptation, Intégration, Réticulation et Evolution (AIRE) Evolution Paris Seine Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS) Université libre de Bruxelles (ULB) Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN) Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU) Département Milieux et Peuplements Aquatiques Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI) Laboratoire de Conception Fabrication Commande (LCFC) Université de Lorraine (UL)-Arts et Métiers Sciences et Technologies HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM) Biogéosciences UMR 6282 Dijon (BGS) Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Laboratoire d'Ichtyologie générale et appliquée Universität Regensburg (UR) 2013 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/document https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/file/pone.0068787.pdf https://doi.org/10.1371/journal.pone.0068787 en eng HAL CCSD Public Library of Science info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0068787 mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/document https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889/file/pone.0068787.pdf doi:10.1371/journal.pone.0068787 http://creativecommons.org/licenses/by/ info:eu-repo/semantics/OpenAccess ISSN: 1932-6203 EISSN: 1932-6203 PLoS ONE https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02921889 PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (8), pp.e68787. ⟨10.1371/journal.pone.0068787⟩ [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] info:eu-repo/semantics/article Journal articles 2013 ftccsdartic https://doi.org/10.1371/journal.pone.0068787 2021-12-19T00:05:26Z International audience There has been a significant body of literature on species flock definition but not so much about practical means to appraise them. We here apply the five criteria of Eastman and McCune for detecting species flocks in four taxonomic components of the benthic fauna of the Antarctic shelf: teleost fishes, crinoids (feather stars), echinoids (sea urchins) and crustacean arthropods. Practical limitations led us to prioritize the three historical criteria (endemicity, monophyly, species richness) over the two ecological ones (ecological diversity and habitat dominance). We propose a new protocol which includes an iterative fine-tuning of the monophyly and endemicity criteria in order to discover unsuspected flocks. As a result nine « full » species flocks (fulfilling the five criteria) are briefly described. Eight other flocks fit the three historical criteria but need to be further investigated from the ecological point of view (here called « core flocks »). The approach also shows that some candidate taxonomic components are no species flocks at all. The present study contradicts the paradigm that marine species flocks are rare. The hypothesis according to which the Antarctic shelf acts as a species flocks generator is supported, and the approach indicates paths for further ecological studies and may serve as a starting point to investigate the processes leading to flock-like patterning of biodiversity. Article in Journal/Newspaper Antarc* Antarctic Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe) Antarctic Eastman ENVELOPE(-62.985,-62.985,-65.166,-65.166) The Antarctic PLoS ONE 8 8 e68787 |