Detection of the elusive Dwarf sperm whale (Kogia sima) using environmental DNA at Malpelo island (Eastern Pacific, Colombia)

• Published in: Ecology and Evolution
• Main Authors: Juhel, Jean-Baptiste, Marques, Virginie, Polanco Fernandez, Andrea, Borrero-Perez, Giomar H., Mutis Martinezguerra, Maria, Valentini, Alice, Dejean, Tony, Manel, Stephanie, Loiseau, Nicolas, Velez, Laure, Hocdé, Régis, Letessier, Tom B., Richards, Eilish, Hadjadj, Florine, Bessudo, Sandra, Ladino, Felipe, Albouy, Camille, Mouillot, David, Pellissier, Loic
• Other Authors: MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), SPYGEN Le Bourget-du-Lac, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology Zürich (ETH Zürich), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Fédéral de Recherches sur la Forêt, la Neige et le Paysage (WSL), Institut Fédéral de Recherches Suisse
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English
• Published: HAL CCSD 2021
• Subjects: pelagic; megafauna; eDNA; mobile species; [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology; [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes; Pacific; Sperm whale
• Online Access: https://hal.umontpellier.fr/hal-03413614; https://hal.umontpellier.fr/hal-03413614/document; https://hal.umontpellier.fr/hal-03413614/file/Ecology%20and%20Evolution%20-%202021%20-%20Juhel%20-%20Detection%20of%20the%20elusive%20Dwarf%20sperm%20whale%20Kogia%20sima%20using%20environmental%20DNA%20at.pdf; https://doi.org/10.1002/ece3.7057

WOS:000625202600001 International audience Monitoring large marine mammals is challenging due to their low abundances in general, an ability to move over large distances and wide geographical range sizes. The distribution of the pygmy (Kogia breviceps) and dwarf (Kogia sima) sperm whales is informed by relatively rare sightings, which does not permit accurate estimates of their distribution ranges. Hence, their conservation status has long remained Data Deficient (DD) in the Red list of the International Union for Conservation of Nature (IUCN), which prevent appropriate conservation measures. Environmental DNA (eDNA) metabarcoding uses DNA traces left by organisms in their environments to detect the presence of targeted taxon, and is here proved to be useful to increase our knowledge on the distribution of rare but emblematic megafauna. Retrieving eDNA from filtered surface water provides the first detection of the Dwarf sperm whale (Kogia sima) around the remote Malpelo island (Colombia). Environmental DNA collected during oceanic missions can generate better knowledge on rare but emblematic animals even in regions that are generally well sampled for other taxa.