Développement et utilisation des marqueurs génétiques hypervariables chez les espèces marines. Rapport de synthèse 1995-1998

• Main Authors: Bonhomme, Francois, Gerard, Andre
• Format: Report
• Language: French
• Published: 1998
• Subjects: Génétique; Marqueur génétique; Biologie moléculaire; Sélection génétique; Ressource génétique; Recrutement; Bivalvia; Crassostrea; Ostrea; Pisces; Dicentrarchus labrax; Génotypage; Crassostrea gigas
• Online Access: https://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15459/12834.pdf; https://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15459/

L'objectif scientifique de l'Unité de Recherche Marine n0 16 est de partager les savoir faire conceptuels et méthodologiques des deux équipes, pour faire aboutir des programmes appliqués ou fondamentaux dans le domaine de la génétique des organismes marins. Ces programmes concernent plus particulièrement le développement et l'utilisation des marqueurs génétiques fournis par les techniques de biologie moléculaire dans les programmes suivants: Chez les huîtres des genres Ostrea et Crassostrea : Le modèle prioritaire de l'URM sera les huîtres Crassostrea et Ostrea. Pour des raisons historiques, les recherches sur Ostrea sont plus avancées et donneront des résultats plus rapidement. 1-Sélection assistée par marqueurs chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas 1.1. Recherche de marqueurs liés à la résistance à la bonamiose chez Ostrea edulis. 1.2. Recherche de locus à caractère quantitatif (QTL) sur les principaux caractères physiologiques chez Crassostrea gigas et Ostrea eclulis. 1.3. A terme contribution à l'obtention de cartes génétiques chez Crassastrea gigas et Ostrea eclulis. 2-Caractérisation et gestion des ressources génétiques naturelles : 2.1. Etablissement et contrôle génétique d'un conservatoire de souches dans le genre Crassostrea dans le but du maintien et de l'utilisation de la biodiversité. 2.2. Identification génétique et contrôle des stocks chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas. 3-Déterminisme génétique du recrutement: 3.1. Relation hétérozygotie-croissance. 3.2.Génétique en phase larvaire: analyse des paramètres génétiques impliqués dans la croissance et la survie à ce stade. II-Autres espèces : Des collaborations sont envisagées avec des laboratoires d'IFREMER impliqués dans des programmes similaires. Cela pourra se faire par des moyens annexes comme l'accueil de stagiaires ou de doctorants. La présente structure pourrait également servir de centre d'accueil pour d'autres équipes françaises (Université ou autres organismes) désireuses de développer des recherches dans ce domaine. Des propositions seront faites aux différentes instances concernées (CNRS, ORSTOM, Universités) pour la mise sur pied éventuelle d'un centre de formation en génétique des espèces marines. L'URM 16 aura ainsi vocation à aborder chez les poissons des problèmes analogues à ceux cités précédemment, par exemple chez le loup Dicentrarchus labrax. Une collaboration entre le GPI et l'ifremer-Palavas est déjà en cours sur cette espèce: elle a donné lieu à l'identification de marqueurs microsatellites (8). Ces marqueurs ont étédéveloppés pour deux raisons principales qui correspondent aux objectifs affichés par l'URM : 1-Utilisation dans des tests de patemité, génotypage des géniteurs. 2-Evaluation de la biodiversité dans l'espèce D. labrax et identification génétique des stocks de ce poisson dans le Bassin Méditerranéen. 3- Aide à la sélection. L'URM 16 aura également vocation à travailler sur d'autres espèces cultivées comme les crevettes du genre Penaeus. Une collaboration entre le GPI et le Ifremer-Tahiti est en effet en cours sur l'identification de marqueurs microsatellites, initiée dans le cadre de l'appel d'offres Biotechnologie 93 de l'ifremer. Les premiers microsatellites ont, là aussi, été identifiés. Cette démarche a été amorcée dans un but de : 1-Génotypage des géniteurs, 2-0util de simplification des procédures d'expérimentation (possibilité de mélange de différents lots avec assurance de pouvoir les départager par la suite), 3-Evaluation du polymorphisme des populations d'élevage, 4-Aide à la sélection.