Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata
Les deux sous-espèces d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata originaires d'Asie, sont aujourd'hui présentes en Europe. A la suite de l'observation d'hybridation entre les deux taxons en milieu contrôlé, nous nous sommes demandés s'il existait des ph...
Main Author: | |
---|---|
Format: | Report |
Language: | French |
Published: |
2000
|
Subjects: | |
Online Access: | https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/11652.pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/ |
id |
ftarchimer:oai:archimer.ifremer.fr:14363 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftarchimer:oai:archimer.ifremer.fr:14363 2023-05-15T15:57:55+02:00 Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata Fabioux, Caroline 2000 application/pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/11652.pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/ fre fre https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/11652.pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/ 2000 UBO, Ifremer, The author info:eu-repo/semantics/openAccess restricted use Crassostrea gigas Crassostrea angulata Hybridation Différenciation Marqueurs moléculaires text Report info:eu-repo/semantics/report 2000 ftarchimer 2021-09-23T20:19:15Z Les deux sous-espèces d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata originaires d'Asie, sont aujourd'hui présentes en Europe. A la suite de l'observation d'hybridation entre les deux taxons en milieu contrôlé, nous nous sommes demandés s'il existait des phénomènes d'hybridation dans la nature et quels étaient les flux géniques entre les populations des deux taxons. Neuf populations ont été échantillonnées le long des côtes atlantiques de la France, de l'Espagne et du Portugal. La classification des individus dans le taxon C. gigas ou C. angulata peut être déterminée par leur haplotype au locus mitochondrial de la Cytochrome Oxydase I, analysé par la technique de PCR-RFLP. En France et en Espagne, le taxon C. gigas représente plus de 99,9% des individus. Une seule population en mélange significatif est observée, au sud du Portugal. Au vu des faibles effectifs de C. angulata observés en Europe, nous pouvons nous interroger sur la survie de ce taxon face à l'expansion des populations de C. gigas. Pour étudier la structuration génétique des populations, trois marqueurs nucléaires introniques ou anonymes ont été analysés. Les résultats montrent des forts déficits en hétérozygotes pour chaque marqueur. Le Fst moyen par résultats montrent des forts déficits en hétérozygotes pour chaque marqueur. Le Fst moyen par paire de populations, non significativement différent de zéro, n'indique aucune différenciation génétique entre les échantillons. L'hybridation a été étudiée grâce à un marqueur nucléaire génétique entre les échantillons. L'hybridation a été étudiée grâce à un marqueur nucléaire pseudo-spécifique, CG44R, situé en amont d'une séquence microsatellite. Les résultats obtenus mettent en évidence l'existence de phénomènes d'hybridation naturelle entre C. gigas et C. angulata dans le sud du Portugal, où les activités ostréicoles ont remis les deux taxons en contact. L'analyse des populations asiatiques d'origine, des deux sous-espèces, suggère que la spécificité du marqueur CG44R est antérieure à l'importation des deux taxons en Europe. Report Crassostrea gigas Archimer (Archive Institutionnelle de l'Ifremer - Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer) |
institution |
Open Polar |
collection |
Archimer (Archive Institutionnelle de l'Ifremer - Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer) |
op_collection_id |
ftarchimer |
language |
French |
topic |
Crassostrea gigas Crassostrea angulata Hybridation Différenciation Marqueurs moléculaires |
spellingShingle |
Crassostrea gigas Crassostrea angulata Hybridation Différenciation Marqueurs moléculaires Fabioux, Caroline Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
topic_facet |
Crassostrea gigas Crassostrea angulata Hybridation Différenciation Marqueurs moléculaires |
description |
Les deux sous-espèces d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata originaires d'Asie, sont aujourd'hui présentes en Europe. A la suite de l'observation d'hybridation entre les deux taxons en milieu contrôlé, nous nous sommes demandés s'il existait des phénomènes d'hybridation dans la nature et quels étaient les flux géniques entre les populations des deux taxons. Neuf populations ont été échantillonnées le long des côtes atlantiques de la France, de l'Espagne et du Portugal. La classification des individus dans le taxon C. gigas ou C. angulata peut être déterminée par leur haplotype au locus mitochondrial de la Cytochrome Oxydase I, analysé par la technique de PCR-RFLP. En France et en Espagne, le taxon C. gigas représente plus de 99,9% des individus. Une seule population en mélange significatif est observée, au sud du Portugal. Au vu des faibles effectifs de C. angulata observés en Europe, nous pouvons nous interroger sur la survie de ce taxon face à l'expansion des populations de C. gigas. Pour étudier la structuration génétique des populations, trois marqueurs nucléaires introniques ou anonymes ont été analysés. Les résultats montrent des forts déficits en hétérozygotes pour chaque marqueur. Le Fst moyen par résultats montrent des forts déficits en hétérozygotes pour chaque marqueur. Le Fst moyen par paire de populations, non significativement différent de zéro, n'indique aucune différenciation génétique entre les échantillons. L'hybridation a été étudiée grâce à un marqueur nucléaire génétique entre les échantillons. L'hybridation a été étudiée grâce à un marqueur nucléaire pseudo-spécifique, CG44R, situé en amont d'une séquence microsatellite. Les résultats obtenus mettent en évidence l'existence de phénomènes d'hybridation naturelle entre C. gigas et C. angulata dans le sud du Portugal, où les activités ostréicoles ont remis les deux taxons en contact. L'analyse des populations asiatiques d'origine, des deux sous-espèces, suggère que la spécificité du marqueur CG44R est antérieure à l'importation des deux taxons en Europe. |
format |
Report |
author |
Fabioux, Caroline |
author_facet |
Fabioux, Caroline |
author_sort |
Fabioux, Caroline |
title |
Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
title_short |
Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
title_full |
Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
title_fullStr |
Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
title_full_unstemmed |
Différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas et Crassostrea angulata |
title_sort |
différenciation génétique et hybridation entre les populations naturelles d'huîtres creuses crassostrea gigas et crassostrea angulata |
publishDate |
2000 |
url |
https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/11652.pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/ |
genre |
Crassostrea gigas |
genre_facet |
Crassostrea gigas |
op_relation |
https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/11652.pdf https://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14363/ |
op_rights |
2000 UBO, Ifremer, The author info:eu-repo/semantics/openAccess restricted use |
_version_ |
1766393625795624960 |