Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı

Trionychidae familyasındaki kaplumbağalar Antartika kıtası hariç tüm kıtalarda yayılış göstermekle birlikte 14 cins ve bu cinslere giren 30 tür ile temsil edilirler. Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Forskal, 1775) Afrika kıtasında Moritanya ve kuzey Namibya’dan Mısır’a ve Orta Do...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Güçlü, Özgür
Other Authors: Ülger, Celal, Türkozan, Oğuz, Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:Turkish
Published: Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü 2010
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11607/765
http://194.27.38.21/web/catalog/info.php?idx=32909173&idt=1
id ftadnanmenderes:oai:adudspace.adu.edu.tr:8080:11607/765
record_format openpolar
spelling ftadnanmenderes:oai:adudspace.adu.edu.tr:8080:11607/765 2023-05-15T14:00:23+02:00 Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı The genetic structure of nile soft-shelled turtles, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populations Güçlü, Özgür Ülger, Celal Türkozan, Oğuz Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı 2010-01-01 http://hdl.handle.net/11607/765 http://194.27.38.21/web/catalog/info.php?idx=32909173&idt=1 tur tur Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü http://194.27.38.21/web/catalog/info.php?idx=32909173&idt=1 http://hdl.handle.net/11607/765 info:eu-repo/semantics/openAccess Trionyx Triunguis mtDNA Mikrosatellit Koruma Genetiği Populasyon Genetiği Microsatellite Conservation Genetics Population Genetics doctoralThesis 2010 ftadnanmenderes 2022-03-02T17:05:46Z Trionychidae familyasındaki kaplumbağalar Antartika kıtası hariç tüm kıtalarda yayılış göstermekle birlikte 14 cins ve bu cinslere giren 30 tür ile temsil edilirler. Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Forskal, 1775) Afrika kıtasında Moritanya ve kuzey Namibya’dan Mısır’a ve Orta Doğu’da İsrail, Suriye ve Türkiye’de yayılış göstermektedir. Güney Afrika dışında Afrika kıtasının büyük çoğunluğuna dağılmıştır. T. triunguis türünün populasyon yapısı ve genetiği üzerine fazla çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı Akdeniz ve Afrika kıtasındaki çeşitli lokalitelerden elde edilen örnekler ile T. triunguis’in genetiksel stok verilerini elde etmektir. Bunun için dokuz mikrosatellit lokusu (n=102) ve mitokondrial DNA kontrol bölgesi dizisi (n=52) kullanılmıştır. Bu çalışma ile dizayn edilen mtDNA kontrol bölgesi primerlerleri ile 13 haplotip bulunmuştur. Ayrıca kullanılan 9 mikrosatellit lokusundan 3’ünün polimorfik olduğu belirlenmiştir. Hem mtDNA hem de mikrosatellit verilerine göre Türkiye’nin batı ve doğu sahilleri ile Afrika kıtası arasında genetiksel farklılaşma olduğu belirlenmiştir. Bu genetiksel yapılaşma üç populasyonun da “Evrimsel Önemli Birimler” olarak değerlendirilmesi gerektiğini ortaya çıkarmıştır. Turtles belonging to the Trionychidae family are dispersed in all continents except Antarctica and are currently represented by 30 species distributed in 14 genera. The Nile soft shell turtle, Trionyx triunguis (Forskal, 1775), is distributed in Turkey, Syria, and Israel in the Middle East and from Mauritania and North Namibia to Egypt in African continent. They are spread all over the vast majority of Africa, except in the southern part of the continent. There are not a many studies about the population structure and genetics of T. triunguis. The aim of the study is to provide inventory data on the genetic structure of T. triunguis with the samples provided from different localities in the Mediterranean and African continent. With this purpose, mitochondrial DNA control region sequences (n=52) and nine microsatellite loci (n=102) are used. The 13 haplotypes with the primers that we designed for mtDNA control region and 3 polymorphic microsatellite markers in 9 microsatellite loci are founded. Both mtDNA and microsatellite data showed genetic divergence between the eastern and western populations of Turkey and the African continent. This genetic structuring show us to evaluate the three population as an “Evolutionarily Significant Unit”. Doctoral or Postdoctoral Thesis Antarc* Antarctica Adnan Menderes University: eArsiv@Adu Orta ENVELOPE(6.658,6.658,62.783,62.783)
institution Open Polar
collection Adnan Menderes University: eArsiv@Adu
op_collection_id ftadnanmenderes
language Turkish
topic Trionyx Triunguis
mtDNA
Mikrosatellit
Koruma Genetiği
Populasyon Genetiği
Microsatellite
Conservation Genetics
Population Genetics
spellingShingle Trionyx Triunguis
mtDNA
Mikrosatellit
Koruma Genetiği
Populasyon Genetiği
Microsatellite
Conservation Genetics
Population Genetics
Güçlü, Özgür
Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
topic_facet Trionyx Triunguis
mtDNA
Mikrosatellit
Koruma Genetiği
Populasyon Genetiği
Microsatellite
Conservation Genetics
Population Genetics
description Trionychidae familyasındaki kaplumbağalar Antartika kıtası hariç tüm kıtalarda yayılış göstermekle birlikte 14 cins ve bu cinslere giren 30 tür ile temsil edilirler. Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Forskal, 1775) Afrika kıtasında Moritanya ve kuzey Namibya’dan Mısır’a ve Orta Doğu’da İsrail, Suriye ve Türkiye’de yayılış göstermektedir. Güney Afrika dışında Afrika kıtasının büyük çoğunluğuna dağılmıştır. T. triunguis türünün populasyon yapısı ve genetiği üzerine fazla çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı Akdeniz ve Afrika kıtasındaki çeşitli lokalitelerden elde edilen örnekler ile T. triunguis’in genetiksel stok verilerini elde etmektir. Bunun için dokuz mikrosatellit lokusu (n=102) ve mitokondrial DNA kontrol bölgesi dizisi (n=52) kullanılmıştır. Bu çalışma ile dizayn edilen mtDNA kontrol bölgesi primerlerleri ile 13 haplotip bulunmuştur. Ayrıca kullanılan 9 mikrosatellit lokusundan 3’ünün polimorfik olduğu belirlenmiştir. Hem mtDNA hem de mikrosatellit verilerine göre Türkiye’nin batı ve doğu sahilleri ile Afrika kıtası arasında genetiksel farklılaşma olduğu belirlenmiştir. Bu genetiksel yapılaşma üç populasyonun da “Evrimsel Önemli Birimler” olarak değerlendirilmesi gerektiğini ortaya çıkarmıştır. Turtles belonging to the Trionychidae family are dispersed in all continents except Antarctica and are currently represented by 30 species distributed in 14 genera. The Nile soft shell turtle, Trionyx triunguis (Forskal, 1775), is distributed in Turkey, Syria, and Israel in the Middle East and from Mauritania and North Namibia to Egypt in African continent. They are spread all over the vast majority of Africa, except in the southern part of the continent. There are not a many studies about the population structure and genetics of T. triunguis. The aim of the study is to provide inventory data on the genetic structure of T. triunguis with the samples provided from different localities in the Mediterranean and African continent. With this purpose, mitochondrial DNA control region sequences (n=52) and nine microsatellite loci (n=102) are used. The 13 haplotypes with the primers that we designed for mtDNA control region and 3 polymorphic microsatellite markers in 9 microsatellite loci are founded. Both mtDNA and microsatellite data showed genetic divergence between the eastern and western populations of Turkey and the African continent. This genetic structuring show us to evaluate the three population as an “Evolutionarily Significant Unit”.
author2 Ülger, Celal
Türkozan, Oğuz
Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı
format Doctoral or Postdoctoral Thesis
author Güçlü, Özgür
author_facet Güçlü, Özgür
author_sort Güçlü, Özgür
title Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
title_short Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
title_full Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
title_fullStr Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
title_full_unstemmed Nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, Trionyx triunguis (Testudines: Trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
title_sort nil yumuşak kabuklu kaplumbağası, trionyx triunguis (testudines: trionychidae), populasyonlarının genetik yapısı
publisher Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü
publishDate 2010
url http://hdl.handle.net/11607/765
http://194.27.38.21/web/catalog/info.php?idx=32909173&idt=1
long_lat ENVELOPE(6.658,6.658,62.783,62.783)
geographic Orta
geographic_facet Orta
genre Antarc*
Antarctica
genre_facet Antarc*
Antarctica
op_relation http://194.27.38.21/web/catalog/info.php?idx=32909173&idt=1
http://hdl.handle.net/11607/765
op_rights info:eu-repo/semantics/openAccess
_version_ 1766269476563582976